Protein–RNA interactions for Protein: Q99742

NPAS1, Neuronal PAS domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPAS1Q99742 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NPAS1Q99742 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NPAS1Q99742 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NPAS1Q99742 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NPAS1Q99742 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NPAS1Q99742 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
NPAS1Q99742 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
NPAS1Q99742 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NPAS1Q99742 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
NPAS1Q99742 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NPAS1Q99742 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NPAS1Q99742 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NPAS1Q99742 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NPAS1Q99742 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
NPAS1Q99742 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NPAS1Q99742 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NPAS1Q99742 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
NPAS1Q99742 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NPAS1Q99742 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NPAS1Q99742 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NPAS1Q99742 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
NPAS1Q99742 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
NPAS1Q99742 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NPAS1Q99742 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NPAS1Q99742 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NPAS1Q99742 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NPAS1Q99742 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NPAS1Q99742 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NPAS1Q99742 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NPAS1Q99742 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NPAS1Q99742 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NPAS1Q99742 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NPAS1Q99742 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NPAS1Q99742 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NPAS1Q99742 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NPAS1Q99742 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
NPAS1Q99742 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NPAS1Q99742 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NPAS1Q99742 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NPAS1Q99742 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NPAS1Q99742 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NPAS1Q99742 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NPAS1Q99742 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
NPAS1Q99742 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NPAS1Q99742 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NPAS1Q99742 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NPAS1Q99742 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NPAS1Q99742 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NPAS1Q99742 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NPAS1Q99742 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NPAS1Q99742 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NPAS1Q99742 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NPAS1Q99742 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
NPAS1Q99742 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NPAS1Q99742 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NPAS1Q99742 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NPAS1Q99742 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NPAS1Q99742 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NPAS1Q99742 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NPAS1Q99742 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NPAS1Q99742 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NPAS1Q99742 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NPAS1Q99742 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NPAS1Q99742 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NPAS1Q99742 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NPAS1Q99742 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NPAS1Q99742 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NPAS1Q99742 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NPAS1Q99742 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NPAS1Q99742 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
NPAS1Q99742 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
NPAS1Q99742 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
NPAS1Q99742 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NPAS1Q99742 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NPAS1Q99742 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NPAS1Q99742 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NPAS1Q99742 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NPAS1Q99742 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NPAS1Q99742 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NPAS1Q99742 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NPAS1Q99742 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NPAS1Q99742 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NPAS1Q99742 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NPAS1Q99742 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NPAS1Q99742 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NPAS1Q99742 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NPAS1Q99742 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NPAS1Q99742 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NPAS1Q99742 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NPAS1Q99742 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NPAS1Q99742 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NPAS1Q99742 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
NPAS1Q99742 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NPAS1Q99742 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NPAS1Q99742 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NPAS1Q99742 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NPAS1Q99742 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NPAS1Q99742 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NPAS1Q99742 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NPAS1Q99742 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms