Protein–RNA interactions for Protein: Q96T66

NMNAT3, Nicotinamide/nicotinic acid mononucleotide adenylyltransferase 3, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMNAT3Q96T66 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NMNAT3Q96T66 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NMNAT3Q96T66 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NMNAT3Q96T66 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NMNAT3Q96T66 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NMNAT3Q96T66 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NMNAT3Q96T66 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NMNAT3Q96T66 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
NMNAT3Q96T66 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NMNAT3Q96T66 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NMNAT3Q96T66 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NMNAT3Q96T66 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NMNAT3Q96T66 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NMNAT3Q96T66 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NMNAT3Q96T66 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NMNAT3Q96T66 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NMNAT3Q96T66 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NMNAT3Q96T66 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NMNAT3Q96T66 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NMNAT3Q96T66 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NMNAT3Q96T66 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NMNAT3Q96T66 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NMNAT3Q96T66 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NMNAT3Q96T66 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NMNAT3Q96T66 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NMNAT3Q96T66 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NMNAT3Q96T66 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NMNAT3Q96T66 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NMNAT3Q96T66 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NMNAT3Q96T66 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NMNAT3Q96T66 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NMNAT3Q96T66 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NMNAT3Q96T66 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NMNAT3Q96T66 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NMNAT3Q96T66 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NMNAT3Q96T66 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NMNAT3Q96T66 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NMNAT3Q96T66 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NMNAT3Q96T66 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NMNAT3Q96T66 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NMNAT3Q96T66 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NMNAT3Q96T66 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NMNAT3Q96T66 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NMNAT3Q96T66 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NMNAT3Q96T66 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NMNAT3Q96T66 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NMNAT3Q96T66 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NMNAT3Q96T66 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NMNAT3Q96T66 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NMNAT3Q96T66 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NMNAT3Q96T66 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NMNAT3Q96T66 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NMNAT3Q96T66 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NMNAT3Q96T66 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NMNAT3Q96T66 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NMNAT3Q96T66 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NMNAT3Q96T66 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NMNAT3Q96T66 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NMNAT3Q96T66 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NMNAT3Q96T66 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NMNAT3Q96T66 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NMNAT3Q96T66 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NMNAT3Q96T66 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NMNAT3Q96T66 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NMNAT3Q96T66 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NMNAT3Q96T66 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NMNAT3Q96T66 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NMNAT3Q96T66 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
NMNAT3Q96T66 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
NMNAT3Q96T66 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NMNAT3Q96T66 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NMNAT3Q96T66 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
NMNAT3Q96T66 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
NMNAT3Q96T66 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
NMNAT3Q96T66 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NMNAT3Q96T66 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NMNAT3Q96T66 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NMNAT3Q96T66 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NMNAT3Q96T66 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NMNAT3Q96T66 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NMNAT3Q96T66 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NMNAT3Q96T66 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NMNAT3Q96T66 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
NMNAT3Q96T66 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NMNAT3Q96T66 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NMNAT3Q96T66 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NMNAT3Q96T66 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NMNAT3Q96T66 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NMNAT3Q96T66 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NMNAT3Q96T66 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NMNAT3Q96T66 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NMNAT3Q96T66 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NMNAT3Q96T66 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NMNAT3Q96T66 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NMNAT3Q96T66 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NMNAT3Q96T66 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NMNAT3Q96T66 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NMNAT3Q96T66 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NMNAT3Q96T66 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NMNAT3Q96T66 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms