Protein–RNA interactions for Protein: Q96L94

SNX22, Sorting nexin-22, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX22Q96L94 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SNX22Q96L94 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SNX22Q96L94 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SNX22Q96L94 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SNX22Q96L94 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SNX22Q96L94 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SNX22Q96L94 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SNX22Q96L94 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SNX22Q96L94 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SNX22Q96L94 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SNX22Q96L94 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SNX22Q96L94 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SNX22Q96L94 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SNX22Q96L94 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SNX22Q96L94 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SNX22Q96L94 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SNX22Q96L94 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SNX22Q96L94 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SNX22Q96L94 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SNX22Q96L94 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SNX22Q96L94 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SNX22Q96L94 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SNX22Q96L94 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SNX22Q96L94 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SNX22Q96L94 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SNX22Q96L94 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SNX22Q96L94 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SNX22Q96L94 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SNX22Q96L94 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SNX22Q96L94 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SNX22Q96L94 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNX22Q96L94 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SNX22Q96L94 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNX22Q96L94 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNX22Q96L94 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SNX22Q96L94 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNX22Q96L94 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SNX22Q96L94 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SNX22Q96L94 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SNX22Q96L94 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SNX22Q96L94 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNX22Q96L94 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SNX22Q96L94 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNX22Q96L94 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNX22Q96L94 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SNX22Q96L94 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNX22Q96L94 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNX22Q96L94 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNX22Q96L94 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SNX22Q96L94 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SNX22Q96L94 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SNX22Q96L94 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SNX22Q96L94 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SNX22Q96L94 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNX22Q96L94 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SNX22Q96L94 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SNX22Q96L94 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SNX22Q96L94 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SNX22Q96L94 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SNX22Q96L94 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNX22Q96L94 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNX22Q96L94 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SNX22Q96L94 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNX22Q96L94 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNX22Q96L94 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNX22Q96L94 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SNX22Q96L94 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SNX22Q96L94 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNX22Q96L94 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNX22Q96L94 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNX22Q96L94 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNX22Q96L94 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNX22Q96L94 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNX22Q96L94 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNX22Q96L94 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SNX22Q96L94 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNX22Q96L94 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SNX22Q96L94 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNX22Q96L94 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SNX22Q96L94 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNX22Q96L94 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNX22Q96L94 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNX22Q96L94 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SNX22Q96L94 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC15.06■□□□□ 0
SNX22Q96L94 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SNX22Q96L94 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SNX22Q96L94 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNX22Q96L94 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNX22Q96L94 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNX22Q96L94 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SNX22Q96L94 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNX22Q96L94 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNX22Q96L94 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNX22Q96L94 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
SNX22Q96L94 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNX22Q96L94 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SNX22Q96L94 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNX22Q96L94 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNX22Q96L94 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNX22Q96L94 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms