Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB1

ELP4, Elongator complex protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELP4Q96EB1 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ELP4Q96EB1 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ELP4Q96EB1 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ELP4Q96EB1 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ELP4Q96EB1 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ELP4Q96EB1 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ELP4Q96EB1 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ELP4Q96EB1 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ELP4Q96EB1 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ELP4Q96EB1 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ELP4Q96EB1 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ELP4Q96EB1 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ELP4Q96EB1 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ELP4Q96EB1 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ELP4Q96EB1 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ELP4Q96EB1 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ELP4Q96EB1 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ELP4Q96EB1 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ELP4Q96EB1 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ELP4Q96EB1 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ELP4Q96EB1 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ELP4Q96EB1 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ELP4Q96EB1 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ELP4Q96EB1 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ELP4Q96EB1 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ELP4Q96EB1 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ELP4Q96EB1 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ELP4Q96EB1 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ELP4Q96EB1 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ELP4Q96EB1 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ELP4Q96EB1 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ELP4Q96EB1 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ELP4Q96EB1 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ELP4Q96EB1 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ELP4Q96EB1 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ELP4Q96EB1 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ELP4Q96EB1 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ELP4Q96EB1 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ELP4Q96EB1 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ELP4Q96EB1 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ELP4Q96EB1 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ELP4Q96EB1 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ELP4Q96EB1 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ELP4Q96EB1 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ELP4Q96EB1 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ELP4Q96EB1 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ELP4Q96EB1 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ELP4Q96EB1 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ELP4Q96EB1 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ELP4Q96EB1 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ELP4Q96EB1 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ELP4Q96EB1 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ELP4Q96EB1 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ELP4Q96EB1 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ELP4Q96EB1 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
ELP4Q96EB1 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ELP4Q96EB1 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ELP4Q96EB1 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ELP4Q96EB1 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ELP4Q96EB1 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ELP4Q96EB1 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ELP4Q96EB1 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ELP4Q96EB1 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ELP4Q96EB1 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ELP4Q96EB1 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ELP4Q96EB1 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ELP4Q96EB1 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ELP4Q96EB1 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ELP4Q96EB1 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ELP4Q96EB1 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ELP4Q96EB1 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ELP4Q96EB1 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ELP4Q96EB1 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ELP4Q96EB1 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ELP4Q96EB1 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ELP4Q96EB1 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ELP4Q96EB1 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ELP4Q96EB1 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ELP4Q96EB1 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ELP4Q96EB1 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ELP4Q96EB1 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ELP4Q96EB1 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ELP4Q96EB1 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ELP4Q96EB1 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ELP4Q96EB1 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ELP4Q96EB1 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ELP4Q96EB1 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ELP4Q96EB1 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ELP4Q96EB1 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ELP4Q96EB1 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ELP4Q96EB1 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ELP4Q96EB1 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ELP4Q96EB1 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ELP4Q96EB1 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ELP4Q96EB1 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ELP4Q96EB1 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ELP4Q96EB1 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ELP4Q96EB1 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ELP4Q96EB1 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ELP4Q96EB1 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.1 ms