Protein–RNA interactions for Protein: Q96CS3

FAF2, FAS-associated factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAF2Q96CS3 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FAF2Q96CS3 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FAF2Q96CS3 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
FAF2Q96CS3 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
FAF2Q96CS3 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
FAF2Q96CS3 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
FAF2Q96CS3 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
FAF2Q96CS3 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
FAF2Q96CS3 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
FAF2Q96CS3 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
FAF2Q96CS3 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FAF2Q96CS3 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FAF2Q96CS3 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FAF2Q96CS3 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FAF2Q96CS3 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FAF2Q96CS3 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FAF2Q96CS3 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FAF2Q96CS3 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FAF2Q96CS3 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FAF2Q96CS3 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FAF2Q96CS3 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
FAF2Q96CS3 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FAF2Q96CS3 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
FAF2Q96CS3 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
FAF2Q96CS3 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
FAF2Q96CS3 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FAF2Q96CS3 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FAF2Q96CS3 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
FAF2Q96CS3 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
FAF2Q96CS3 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
FAF2Q96CS3 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
FAF2Q96CS3 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
FAF2Q96CS3 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
FAF2Q96CS3 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FAF2Q96CS3 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FAF2Q96CS3 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
FAF2Q96CS3 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FAF2Q96CS3 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
FAF2Q96CS3 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
FAF2Q96CS3 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FAF2Q96CS3 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
FAF2Q96CS3 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
FAF2Q96CS3 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
FAF2Q96CS3 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FAF2Q96CS3 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FAF2Q96CS3 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FAF2Q96CS3 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FAF2Q96CS3 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FAF2Q96CS3 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
FAF2Q96CS3 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FAF2Q96CS3 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FAF2Q96CS3 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
FAF2Q96CS3 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
FAF2Q96CS3 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FAF2Q96CS3 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FAF2Q96CS3 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FAF2Q96CS3 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
FAF2Q96CS3 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FAF2Q96CS3 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
FAF2Q96CS3 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FAF2Q96CS3 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FAF2Q96CS3 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FAF2Q96CS3 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
FAF2Q96CS3 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
FAF2Q96CS3 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FAF2Q96CS3 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
FAF2Q96CS3 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
FAF2Q96CS3 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
FAF2Q96CS3 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FAF2Q96CS3 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FAF2Q96CS3 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
FAF2Q96CS3 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FAF2Q96CS3 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FAF2Q96CS3 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
FAF2Q96CS3 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FAF2Q96CS3 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FAF2Q96CS3 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
FAF2Q96CS3 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FAF2Q96CS3 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
FAF2Q96CS3 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FAF2Q96CS3 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FAF2Q96CS3 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FAF2Q96CS3 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FAF2Q96CS3 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FAF2Q96CS3 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FAF2Q96CS3 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FAF2Q96CS3 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FAF2Q96CS3 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FAF2Q96CS3 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FAF2Q96CS3 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FAF2Q96CS3 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FAF2Q96CS3 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FAF2Q96CS3 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FAF2Q96CS3 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FAF2Q96CS3 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FAF2Q96CS3 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FAF2Q96CS3 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
FAF2Q96CS3 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FAF2Q96CS3 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FAF2Q96CS3 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.7 ms