Protein–RNA interactions for Protein: Q96BF3

TMIGD2, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD2Q96BF3 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMIGD2Q96BF3 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMIGD2Q96BF3 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMIGD2Q96BF3 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMIGD2Q96BF3 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMIGD2Q96BF3 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMIGD2Q96BF3 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMIGD2Q96BF3 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMIGD2Q96BF3 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMIGD2Q96BF3 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMIGD2Q96BF3 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMIGD2Q96BF3 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMIGD2Q96BF3 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMIGD2Q96BF3 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMIGD2Q96BF3 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMIGD2Q96BF3 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMIGD2Q96BF3 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMIGD2Q96BF3 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMIGD2Q96BF3 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMIGD2Q96BF3 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMIGD2Q96BF3 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMIGD2Q96BF3 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMIGD2Q96BF3 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMIGD2Q96BF3 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMIGD2Q96BF3 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMIGD2Q96BF3 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMIGD2Q96BF3 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMIGD2Q96BF3 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMIGD2Q96BF3 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMIGD2Q96BF3 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMIGD2Q96BF3 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMIGD2Q96BF3 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMIGD2Q96BF3 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMIGD2Q96BF3 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMIGD2Q96BF3 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMIGD2Q96BF3 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMIGD2Q96BF3 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMIGD2Q96BF3 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMIGD2Q96BF3 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMIGD2Q96BF3 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMIGD2Q96BF3 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMIGD2Q96BF3 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMIGD2Q96BF3 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMIGD2Q96BF3 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMIGD2Q96BF3 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMIGD2Q96BF3 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMIGD2Q96BF3 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMIGD2Q96BF3 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMIGD2Q96BF3 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMIGD2Q96BF3 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMIGD2Q96BF3 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TMIGD2Q96BF3 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMIGD2Q96BF3 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMIGD2Q96BF3 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TMIGD2Q96BF3 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TMIGD2Q96BF3 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMIGD2Q96BF3 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMIGD2Q96BF3 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMIGD2Q96BF3 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMIGD2Q96BF3 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMIGD2Q96BF3 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMIGD2Q96BF3 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMIGD2Q96BF3 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMIGD2Q96BF3 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMIGD2Q96BF3 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMIGD2Q96BF3 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMIGD2Q96BF3 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMIGD2Q96BF3 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMIGD2Q96BF3 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMIGD2Q96BF3 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMIGD2Q96BF3 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMIGD2Q96BF3 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMIGD2Q96BF3 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMIGD2Q96BF3 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMIGD2Q96BF3 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TMIGD2Q96BF3 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMIGD2Q96BF3 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMIGD2Q96BF3 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMIGD2Q96BF3 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMIGD2Q96BF3 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMIGD2Q96BF3 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMIGD2Q96BF3 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMIGD2Q96BF3 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMIGD2Q96BF3 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMIGD2Q96BF3 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMIGD2Q96BF3 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMIGD2Q96BF3 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMIGD2Q96BF3 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMIGD2Q96BF3 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMIGD2Q96BF3 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMIGD2Q96BF3 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMIGD2Q96BF3 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMIGD2Q96BF3 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMIGD2Q96BF3 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMIGD2Q96BF3 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMIGD2Q96BF3 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMIGD2Q96BF3 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMIGD2Q96BF3 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMIGD2Q96BF3 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMIGD2Q96BF3 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms