Protein–RNA interactions for Protein: Q92547

TOPBP1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPBP1Q92547 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
TOPBP1Q92547 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
TOPBP1Q92547 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
TOPBP1Q92547 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
TOPBP1Q92547 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
TOPBP1Q92547 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
TOPBP1Q92547 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
TOPBP1Q92547 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
TOPBP1Q92547 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
TOPBP1Q92547 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
TOPBP1Q92547 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
TOPBP1Q92547 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
TOPBP1Q92547 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
TOPBP1Q92547 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
TOPBP1Q92547 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
TOPBP1Q92547 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC29.64■■■□□ 2.34
TOPBP1Q92547 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
TOPBP1Q92547 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
TOPBP1Q92547 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
TOPBP1Q92547 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
TOPBP1Q92547 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
TOPBP1Q92547 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
TOPBP1Q92547 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
TOPBP1Q92547 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.33
TOPBP1Q92547 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.33
TOPBP1Q92547 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
TOPBP1Q92547 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
TOPBP1Q92547 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
TOPBP1Q92547 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
TOPBP1Q92547 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
TOPBP1Q92547 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
TOPBP1Q92547 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
TOPBP1Q92547 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
TOPBP1Q92547 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
TOPBP1Q92547 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
TOPBP1Q92547 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC29.63■■■□□ 2.33
TOPBP1Q92547 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
TOPBP1Q92547 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
TOPBP1Q92547 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC29.63■■■□□ 2.33
TOPBP1Q92547 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
TOPBP1Q92547 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
TOPBP1Q92547 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
TOPBP1Q92547 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
TOPBP1Q92547 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
TOPBP1Q92547 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
TOPBP1Q92547 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
TOPBP1Q92547 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
TOPBP1Q92547 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
TOPBP1Q92547 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
TOPBP1Q92547 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
TOPBP1Q92547 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC29.62■■■□□ 2.33
TOPBP1Q92547 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC29.62■■■□□ 2.33
TOPBP1Q92547 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
TOPBP1Q92547 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
TOPBP1Q92547 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
TOPBP1Q92547 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
TOPBP1Q92547 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
TOPBP1Q92547 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
TOPBP1Q92547 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC29.61■■■□□ 2.33
TOPBP1Q92547 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
TOPBP1Q92547 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
TOPBP1Q92547 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
TOPBP1Q92547 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
TOPBP1Q92547 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
TOPBP1Q92547 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
TOPBP1Q92547 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
TOPBP1Q92547 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
TOPBP1Q92547 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
TOPBP1Q92547 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
TOPBP1Q92547 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
TOPBP1Q92547 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
TOPBP1Q92547 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
TOPBP1Q92547 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
TOPBP1Q92547 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
TOPBP1Q92547 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
TOPBP1Q92547 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
TOPBP1Q92547 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
TOPBP1Q92547 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
TOPBP1Q92547 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
TOPBP1Q92547 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
TOPBP1Q92547 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.6■■■□□ 2.33
TOPBP1Q92547 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
TOPBP1Q92547 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC29.6■■■□□ 2.33
TOPBP1Q92547 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
TOPBP1Q92547 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
TOPBP1Q92547 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
TOPBP1Q92547 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
TOPBP1Q92547 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
TOPBP1Q92547 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
TOPBP1Q92547 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
TOPBP1Q92547 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
TOPBP1Q92547 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
TOPBP1Q92547 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
TOPBP1Q92547 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
TOPBP1Q92547 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
TOPBP1Q92547 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
TOPBP1Q92547 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
TOPBP1Q92547 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
TOPBP1Q92547 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
TOPBP1Q92547 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms