Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF548Q8NEK5 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF548Q8NEK5 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF548Q8NEK5 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF548Q8NEK5 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF548Q8NEK5 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF548Q8NEK5 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF548Q8NEK5 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF548Q8NEK5 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF548Q8NEK5 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF548Q8NEK5 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF548Q8NEK5 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF548Q8NEK5 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF548Q8NEK5 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF548Q8NEK5 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF548Q8NEK5 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF548Q8NEK5 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF548Q8NEK5 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF548Q8NEK5 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF548Q8NEK5 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF548Q8NEK5 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF548Q8NEK5 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF548Q8NEK5 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF548Q8NEK5 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF548Q8NEK5 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF548Q8NEK5 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF548Q8NEK5 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF548Q8NEK5 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF548Q8NEK5 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF548Q8NEK5 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF548Q8NEK5 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF548Q8NEK5 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNF548Q8NEK5 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNF548Q8NEK5 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNF548Q8NEK5 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNF548Q8NEK5 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNF548Q8NEK5 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNF548Q8NEK5 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNF548Q8NEK5 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNF548Q8NEK5 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNF548Q8NEK5 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNF548Q8NEK5 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNF548Q8NEK5 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNF548Q8NEK5 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNF548Q8NEK5 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNF548Q8NEK5 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNF548Q8NEK5 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNF548Q8NEK5 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNF548Q8NEK5 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNF548Q8NEK5 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNF548Q8NEK5 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNF548Q8NEK5 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNF548Q8NEK5 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNF548Q8NEK5 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNF548Q8NEK5 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNF548Q8NEK5 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNF548Q8NEK5 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNF548Q8NEK5 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNF548Q8NEK5 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNF548Q8NEK5 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNF548Q8NEK5 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNF548Q8NEK5 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNF548Q8NEK5 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNF548Q8NEK5 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNF548Q8NEK5 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNF548Q8NEK5 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNF548Q8NEK5 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF548Q8NEK5 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF548Q8NEK5 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF548Q8NEK5 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF548Q8NEK5 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF548Q8NEK5 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF548Q8NEK5 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF548Q8NEK5 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF548Q8NEK5 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF548Q8NEK5 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF548Q8NEK5 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF548Q8NEK5 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF548Q8NEK5 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF548Q8NEK5 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF548Q8NEK5 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF548Q8NEK5 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF548Q8NEK5 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF548Q8NEK5 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF548Q8NEK5 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF548Q8NEK5 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF548Q8NEK5 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF548Q8NEK5 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF548Q8NEK5 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF548Q8NEK5 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF548Q8NEK5 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF548Q8NEK5 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF548Q8NEK5 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF548Q8NEK5 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF548Q8NEK5 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF548Q8NEK5 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF548Q8NEK5 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF548Q8NEK5 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF548Q8NEK5 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF548Q8NEK5 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms