Protein–RNA interactions for Protein: Q8N474

SFRP1, Secreted frizzled-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFRP1Q8N474 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SFRP1Q8N474 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SFRP1Q8N474 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SFRP1Q8N474 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SFRP1Q8N474 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SFRP1Q8N474 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SFRP1Q8N474 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SFRP1Q8N474 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SFRP1Q8N474 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SFRP1Q8N474 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SFRP1Q8N474 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SFRP1Q8N474 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SFRP1Q8N474 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SFRP1Q8N474 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SFRP1Q8N474 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SFRP1Q8N474 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SFRP1Q8N474 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SFRP1Q8N474 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SFRP1Q8N474 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SFRP1Q8N474 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SFRP1Q8N474 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SFRP1Q8N474 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SFRP1Q8N474 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SFRP1Q8N474 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SFRP1Q8N474 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SFRP1Q8N474 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SFRP1Q8N474 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SFRP1Q8N474 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SFRP1Q8N474 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SFRP1Q8N474 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SFRP1Q8N474 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SFRP1Q8N474 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SFRP1Q8N474 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SFRP1Q8N474 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SFRP1Q8N474 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SFRP1Q8N474 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SFRP1Q8N474 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SFRP1Q8N474 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SFRP1Q8N474 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SFRP1Q8N474 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SFRP1Q8N474 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SFRP1Q8N474 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SFRP1Q8N474 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SFRP1Q8N474 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SFRP1Q8N474 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SFRP1Q8N474 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SFRP1Q8N474 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SFRP1Q8N474 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SFRP1Q8N474 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SFRP1Q8N474 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SFRP1Q8N474 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SFRP1Q8N474 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SFRP1Q8N474 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SFRP1Q8N474 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SFRP1Q8N474 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SFRP1Q8N474 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SFRP1Q8N474 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SFRP1Q8N474 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SFRP1Q8N474 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SFRP1Q8N474 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SFRP1Q8N474 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SFRP1Q8N474 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SFRP1Q8N474 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SFRP1Q8N474 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SFRP1Q8N474 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SFRP1Q8N474 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SFRP1Q8N474 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SFRP1Q8N474 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SFRP1Q8N474 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SFRP1Q8N474 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SFRP1Q8N474 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SFRP1Q8N474 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SFRP1Q8N474 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SFRP1Q8N474 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SFRP1Q8N474 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SFRP1Q8N474 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SFRP1Q8N474 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SFRP1Q8N474 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SFRP1Q8N474 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SFRP1Q8N474 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SFRP1Q8N474 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SFRP1Q8N474 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SFRP1Q8N474 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SFRP1Q8N474 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
SFRP1Q8N474 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SFRP1Q8N474 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SFRP1Q8N474 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SFRP1Q8N474 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SFRP1Q8N474 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SFRP1Q8N474 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SFRP1Q8N474 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SFRP1Q8N474 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SFRP1Q8N474 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SFRP1Q8N474 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SFRP1Q8N474 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SFRP1Q8N474 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SFRP1Q8N474 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SFRP1Q8N474 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SFRP1Q8N474 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SFRP1Q8N474 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms