Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3S3

PHTF2, Putative homeodomain transcription factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHTF2Q8N3S3 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PHTF2Q8N3S3 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PHTF2Q8N3S3 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PHTF2Q8N3S3 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PHTF2Q8N3S3 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PHTF2Q8N3S3 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PHTF2Q8N3S3 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PHTF2Q8N3S3 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PHTF2Q8N3S3 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PHTF2Q8N3S3 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PHTF2Q8N3S3 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PHTF2Q8N3S3 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PHTF2Q8N3S3 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PHTF2Q8N3S3 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PHTF2Q8N3S3 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PHTF2Q8N3S3 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PHTF2Q8N3S3 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PHTF2Q8N3S3 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PHTF2Q8N3S3 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PHTF2Q8N3S3 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PHTF2Q8N3S3 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PHTF2Q8N3S3 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PHTF2Q8N3S3 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PHTF2Q8N3S3 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PHTF2Q8N3S3 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PHTF2Q8N3S3 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PHTF2Q8N3S3 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PHTF2Q8N3S3 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PHTF2Q8N3S3 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PHTF2Q8N3S3 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PHTF2Q8N3S3 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PHTF2Q8N3S3 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PHTF2Q8N3S3 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PHTF2Q8N3S3 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PHTF2Q8N3S3 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PHTF2Q8N3S3 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PHTF2Q8N3S3 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PHTF2Q8N3S3 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PHTF2Q8N3S3 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PHTF2Q8N3S3 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PHTF2Q8N3S3 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PHTF2Q8N3S3 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PHTF2Q8N3S3 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PHTF2Q8N3S3 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PHTF2Q8N3S3 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PHTF2Q8N3S3 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PHTF2Q8N3S3 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PHTF2Q8N3S3 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PHTF2Q8N3S3 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PHTF2Q8N3S3 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PHTF2Q8N3S3 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PHTF2Q8N3S3 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PHTF2Q8N3S3 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PHTF2Q8N3S3 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PHTF2Q8N3S3 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PHTF2Q8N3S3 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PHTF2Q8N3S3 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PHTF2Q8N3S3 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PHTF2Q8N3S3 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PHTF2Q8N3S3 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PHTF2Q8N3S3 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PHTF2Q8N3S3 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PHTF2Q8N3S3 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PHTF2Q8N3S3 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PHTF2Q8N3S3 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PHTF2Q8N3S3 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PHTF2Q8N3S3 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PHTF2Q8N3S3 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PHTF2Q8N3S3 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PHTF2Q8N3S3 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PHTF2Q8N3S3 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PHTF2Q8N3S3 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PHTF2Q8N3S3 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PHTF2Q8N3S3 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PHTF2Q8N3S3 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PHTF2Q8N3S3 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PHTF2Q8N3S3 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PHTF2Q8N3S3 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PHTF2Q8N3S3 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PHTF2Q8N3S3 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PHTF2Q8N3S3 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PHTF2Q8N3S3 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PHTF2Q8N3S3 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PHTF2Q8N3S3 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PHTF2Q8N3S3 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PHTF2Q8N3S3 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PHTF2Q8N3S3 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PHTF2Q8N3S3 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PHTF2Q8N3S3 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PHTF2Q8N3S3 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PHTF2Q8N3S3 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PHTF2Q8N3S3 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PHTF2Q8N3S3 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PHTF2Q8N3S3 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PHTF2Q8N3S3 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PHTF2Q8N3S3 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PHTF2Q8N3S3 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PHTF2Q8N3S3 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PHTF2Q8N3S3 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PHTF2Q8N3S3 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.2 ms