Protein–RNA interactions for Protein: Q86UT8

CCDC84, Coiled-coil domain-containing protein 84, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC84Q86UT8 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC84Q86UT8 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC84Q86UT8 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC84Q86UT8 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC84Q86UT8 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC84Q86UT8 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC84Q86UT8 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC84Q86UT8 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC84Q86UT8 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC84Q86UT8 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC84Q86UT8 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC84Q86UT8 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC84Q86UT8 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC84Q86UT8 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC84Q86UT8 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC84Q86UT8 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC84Q86UT8 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC84Q86UT8 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC84Q86UT8 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC84Q86UT8 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC84Q86UT8 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC84Q86UT8 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC84Q86UT8 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC84Q86UT8 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC84Q86UT8 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC84Q86UT8 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC84Q86UT8 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC84Q86UT8 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC84Q86UT8 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC84Q86UT8 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC84Q86UT8 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC84Q86UT8 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC84Q86UT8 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC84Q86UT8 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC84Q86UT8 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC84Q86UT8 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC84Q86UT8 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC84Q86UT8 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC84Q86UT8 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC84Q86UT8 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC84Q86UT8 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC84Q86UT8 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC84Q86UT8 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC84Q86UT8 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC84Q86UT8 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC84Q86UT8 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC84Q86UT8 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC84Q86UT8 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC84Q86UT8 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC84Q86UT8 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC84Q86UT8 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC84Q86UT8 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC84Q86UT8 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC84Q86UT8 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC84Q86UT8 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC84Q86UT8 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC84Q86UT8 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC84Q86UT8 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC84Q86UT8 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC84Q86UT8 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC84Q86UT8 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC84Q86UT8 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC84Q86UT8 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC84Q86UT8 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC84Q86UT8 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC84Q86UT8 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC84Q86UT8 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC84Q86UT8 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC84Q86UT8 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC84Q86UT8 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC84Q86UT8 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC84Q86UT8 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC84Q86UT8 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC84Q86UT8 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC84Q86UT8 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC84Q86UT8 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC84Q86UT8 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC84Q86UT8 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC84Q86UT8 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC84Q86UT8 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC84Q86UT8 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC84Q86UT8 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC84Q86UT8 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC84Q86UT8 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC84Q86UT8 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC84Q86UT8 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC84Q86UT8 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC84Q86UT8 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC84Q86UT8 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC84Q86UT8 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC84Q86UT8 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC84Q86UT8 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC84Q86UT8 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC84Q86UT8 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC84Q86UT8 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC84Q86UT8 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC84Q86UT8 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC84Q86UT8 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC84Q86UT8 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC84Q86UT8 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms