Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3V4

UBE3B, Ubiquitin-protein ligase E3B, humanhuman

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3BQ7Z3V4 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBE3BQ7Z3V4 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBE3BQ7Z3V4 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBE3BQ7Z3V4 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBE3BQ7Z3V4 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBE3BQ7Z3V4 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBE3BQ7Z3V4 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBE3BQ7Z3V4 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBE3BQ7Z3V4 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBE3BQ7Z3V4 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBE3BQ7Z3V4 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBE3BQ7Z3V4 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
UBE3BQ7Z3V4 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBE3BQ7Z3V4 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBE3BQ7Z3V4 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
UBE3BQ7Z3V4 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBE3BQ7Z3V4 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBE3BQ7Z3V4 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBE3BQ7Z3V4 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBE3BQ7Z3V4 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBE3BQ7Z3V4 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBE3BQ7Z3V4 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBE3BQ7Z3V4 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBE3BQ7Z3V4 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBE3BQ7Z3V4 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBE3BQ7Z3V4 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBE3BQ7Z3V4 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBE3BQ7Z3V4 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBE3BQ7Z3V4 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBE3BQ7Z3V4 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBE3BQ7Z3V4 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBE3BQ7Z3V4 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBE3BQ7Z3V4 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
UBE3BQ7Z3V4 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBE3BQ7Z3V4 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBE3BQ7Z3V4 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBE3BQ7Z3V4 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBE3BQ7Z3V4 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBE3BQ7Z3V4 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
UBE3BQ7Z3V4 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBE3BQ7Z3V4 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBE3BQ7Z3V4 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBE3BQ7Z3V4 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBE3BQ7Z3V4 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBE3BQ7Z3V4 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBE3BQ7Z3V4 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBE3BQ7Z3V4 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBE3BQ7Z3V4 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBE3BQ7Z3V4 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBE3BQ7Z3V4 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBE3BQ7Z3V4 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBE3BQ7Z3V4 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBE3BQ7Z3V4 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBE3BQ7Z3V4 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBE3BQ7Z3V4 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBE3BQ7Z3V4 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBE3BQ7Z3V4 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBE3BQ7Z3V4 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
UBE3BQ7Z3V4 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBE3BQ7Z3V4 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
UBE3BQ7Z3V4 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBE3BQ7Z3V4 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBE3BQ7Z3V4 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBE3BQ7Z3V4 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBE3BQ7Z3V4 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBE3BQ7Z3V4 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBE3BQ7Z3V4 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBE3BQ7Z3V4 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBE3BQ7Z3V4 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBE3BQ7Z3V4 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBE3BQ7Z3V4 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBE3BQ7Z3V4 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBE3BQ7Z3V4 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBE3BQ7Z3V4 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBE3BQ7Z3V4 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBE3BQ7Z3V4 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBE3BQ7Z3V4 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBE3BQ7Z3V4 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBE3BQ7Z3V4 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
UBE3BQ7Z3V4 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBE3BQ7Z3V4 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBE3BQ7Z3V4 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBE3BQ7Z3V4 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBE3BQ7Z3V4 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBE3BQ7Z3V4 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBE3BQ7Z3V4 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
UBE3BQ7Z3V4 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBE3BQ7Z3V4 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBE3BQ7Z3V4 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
UBE3BQ7Z3V4 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBE3BQ7Z3V4 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBE3BQ7Z3V4 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBE3BQ7Z3V4 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
UBE3BQ7Z3V4 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBE3BQ7Z3V4 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBE3BQ7Z3V4 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBE3BQ7Z3V4 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBE3BQ7Z3V4 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBE3BQ7Z3V4 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBE3BQ7Z3V4 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.1 ms