Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTZ2

USP17L1, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L1Q7RTZ2 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP17L1Q7RTZ2 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP17L1Q7RTZ2 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP17L1Q7RTZ2 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP17L1Q7RTZ2 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP17L1Q7RTZ2 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP17L1Q7RTZ2 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP17L1Q7RTZ2 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP17L1Q7RTZ2 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP17L1Q7RTZ2 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP17L1Q7RTZ2 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP17L1Q7RTZ2 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP17L1Q7RTZ2 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP17L1Q7RTZ2 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
USP17L1Q7RTZ2 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP17L1Q7RTZ2 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP17L1Q7RTZ2 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP17L1Q7RTZ2 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP17L1Q7RTZ2 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP17L1Q7RTZ2 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP17L1Q7RTZ2 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP17L1Q7RTZ2 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP17L1Q7RTZ2 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP17L1Q7RTZ2 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP17L1Q7RTZ2 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP17L1Q7RTZ2 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP17L1Q7RTZ2 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP17L1Q7RTZ2 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP17L1Q7RTZ2 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
USP17L1Q7RTZ2 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP17L1Q7RTZ2 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP17L1Q7RTZ2 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP17L1Q7RTZ2 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP17L1Q7RTZ2 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP17L1Q7RTZ2 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP17L1Q7RTZ2 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
USP17L1Q7RTZ2 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP17L1Q7RTZ2 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP17L1Q7RTZ2 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP17L1Q7RTZ2 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP17L1Q7RTZ2 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP17L1Q7RTZ2 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP17L1Q7RTZ2 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP17L1Q7RTZ2 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP17L1Q7RTZ2 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP17L1Q7RTZ2 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP17L1Q7RTZ2 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
USP17L1Q7RTZ2 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP17L1Q7RTZ2 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP17L1Q7RTZ2 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP17L1Q7RTZ2 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP17L1Q7RTZ2 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP17L1Q7RTZ2 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP17L1Q7RTZ2 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP17L1Q7RTZ2 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP17L1Q7RTZ2 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
USP17L1Q7RTZ2 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP17L1Q7RTZ2 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP17L1Q7RTZ2 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP17L1Q7RTZ2 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP17L1Q7RTZ2 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP17L1Q7RTZ2 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP17L1Q7RTZ2 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP17L1Q7RTZ2 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP17L1Q7RTZ2 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP17L1Q7RTZ2 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP17L1Q7RTZ2 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP17L1Q7RTZ2 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP17L1Q7RTZ2 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP17L1Q7RTZ2 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP17L1Q7RTZ2 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP17L1Q7RTZ2 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
USP17L1Q7RTZ2 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP17L1Q7RTZ2 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP17L1Q7RTZ2 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP17L1Q7RTZ2 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP17L1Q7RTZ2 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP17L1Q7RTZ2 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP17L1Q7RTZ2 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP17L1Q7RTZ2 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
USP17L1Q7RTZ2 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
USP17L1Q7RTZ2 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP17L1Q7RTZ2 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP17L1Q7RTZ2 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP17L1Q7RTZ2 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP17L1Q7RTZ2 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP17L1Q7RTZ2 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP17L1Q7RTZ2 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP17L1Q7RTZ2 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP17L1Q7RTZ2 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP17L1Q7RTZ2 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP17L1Q7RTZ2 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
USP17L1Q7RTZ2 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP17L1Q7RTZ2 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP17L1Q7RTZ2 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP17L1Q7RTZ2 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP17L1Q7RTZ2 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
USP17L1Q7RTZ2 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
USP17L1Q7RTZ2 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.02
USP17L1Q7RTZ2 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms