Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSB3

LINC00299, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00299, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00299Q6ZSB3 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00299Q6ZSB3 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00299Q6ZSB3 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00299Q6ZSB3 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00299Q6ZSB3 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00299Q6ZSB3 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00299Q6ZSB3 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00299Q6ZSB3 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00299Q6ZSB3 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00299Q6ZSB3 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00299Q6ZSB3 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00299Q6ZSB3 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00299Q6ZSB3 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00299Q6ZSB3 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00299Q6ZSB3 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00299Q6ZSB3 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00299Q6ZSB3 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00299Q6ZSB3 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00299Q6ZSB3 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00299Q6ZSB3 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00299Q6ZSB3 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00299Q6ZSB3 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00299Q6ZSB3 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00299Q6ZSB3 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00299Q6ZSB3 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00299Q6ZSB3 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00299Q6ZSB3 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00299Q6ZSB3 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00299Q6ZSB3 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00299Q6ZSB3 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00299Q6ZSB3 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00299Q6ZSB3 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00299Q6ZSB3 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00299Q6ZSB3 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00299Q6ZSB3 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00299Q6ZSB3 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00299Q6ZSB3 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00299Q6ZSB3 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00299Q6ZSB3 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00299Q6ZSB3 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00299Q6ZSB3 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00299Q6ZSB3 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00299Q6ZSB3 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00299Q6ZSB3 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00299Q6ZSB3 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00299Q6ZSB3 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00299Q6ZSB3 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00299Q6ZSB3 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00299Q6ZSB3 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00299Q6ZSB3 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00299Q6ZSB3 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00299Q6ZSB3 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00299Q6ZSB3 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00299Q6ZSB3 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00299Q6ZSB3 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00299Q6ZSB3 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00299Q6ZSB3 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00299Q6ZSB3 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00299Q6ZSB3 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00299Q6ZSB3 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00299Q6ZSB3 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00299Q6ZSB3 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00299Q6ZSB3 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00299Q6ZSB3 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00299Q6ZSB3 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00299Q6ZSB3 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00299Q6ZSB3 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00299Q6ZSB3 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00299Q6ZSB3 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00299Q6ZSB3 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00299Q6ZSB3 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00299Q6ZSB3 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00299Q6ZSB3 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00299Q6ZSB3 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00299Q6ZSB3 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00299Q6ZSB3 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00299Q6ZSB3 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00299Q6ZSB3 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00299Q6ZSB3 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00299Q6ZSB3 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00299Q6ZSB3 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00299Q6ZSB3 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00299Q6ZSB3 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00299Q6ZSB3 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00299Q6ZSB3 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00299Q6ZSB3 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00299Q6ZSB3 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00299Q6ZSB3 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00299Q6ZSB3 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00299Q6ZSB3 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00299Q6ZSB3 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00299Q6ZSB3 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00299Q6ZSB3 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00299Q6ZSB3 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00299Q6ZSB3 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00299Q6ZSB3 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00299Q6ZSB3 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00299Q6ZSB3 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00299Q6ZSB3 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00299Q6ZSB3 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.9 ms