Protein–RNA interactions for Protein: Q6UX27

VSTM1, V-set and transmembrane domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM1Q6UX27 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
VSTM1Q6UX27 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
VSTM1Q6UX27 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
VSTM1Q6UX27 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
VSTM1Q6UX27 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
VSTM1Q6UX27 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
VSTM1Q6UX27 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
VSTM1Q6UX27 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
VSTM1Q6UX27 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
VSTM1Q6UX27 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
VSTM1Q6UX27 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
VSTM1Q6UX27 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
VSTM1Q6UX27 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
VSTM1Q6UX27 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
VSTM1Q6UX27 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
VSTM1Q6UX27 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
VSTM1Q6UX27 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
VSTM1Q6UX27 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
VSTM1Q6UX27 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
VSTM1Q6UX27 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
VSTM1Q6UX27 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
VSTM1Q6UX27 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
VSTM1Q6UX27 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
VSTM1Q6UX27 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
VSTM1Q6UX27 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
VSTM1Q6UX27 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
VSTM1Q6UX27 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
VSTM1Q6UX27 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
VSTM1Q6UX27 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
VSTM1Q6UX27 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
VSTM1Q6UX27 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
VSTM1Q6UX27 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
VSTM1Q6UX27 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
VSTM1Q6UX27 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
VSTM1Q6UX27 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
VSTM1Q6UX27 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
VSTM1Q6UX27 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
VSTM1Q6UX27 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
VSTM1Q6UX27 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
VSTM1Q6UX27 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
VSTM1Q6UX27 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
VSTM1Q6UX27 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
VSTM1Q6UX27 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
VSTM1Q6UX27 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
VSTM1Q6UX27 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
VSTM1Q6UX27 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
VSTM1Q6UX27 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
VSTM1Q6UX27 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
VSTM1Q6UX27 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
VSTM1Q6UX27 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
VSTM1Q6UX27 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
VSTM1Q6UX27 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
VSTM1Q6UX27 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
VSTM1Q6UX27 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
VSTM1Q6UX27 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
VSTM1Q6UX27 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
VSTM1Q6UX27 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
VSTM1Q6UX27 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
VSTM1Q6UX27 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
VSTM1Q6UX27 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
VSTM1Q6UX27 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
VSTM1Q6UX27 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
VSTM1Q6UX27 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
VSTM1Q6UX27 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
VSTM1Q6UX27 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
VSTM1Q6UX27 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
VSTM1Q6UX27 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
VSTM1Q6UX27 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
VSTM1Q6UX27 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
VSTM1Q6UX27 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
VSTM1Q6UX27 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
VSTM1Q6UX27 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
VSTM1Q6UX27 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
VSTM1Q6UX27 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
VSTM1Q6UX27 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
VSTM1Q6UX27 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
VSTM1Q6UX27 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
VSTM1Q6UX27 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
VSTM1Q6UX27 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
VSTM1Q6UX27 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
VSTM1Q6UX27 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
VSTM1Q6UX27 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
VSTM1Q6UX27 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
VSTM1Q6UX27 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
VSTM1Q6UX27 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
VSTM1Q6UX27 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
VSTM1Q6UX27 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
VSTM1Q6UX27 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
VSTM1Q6UX27 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
VSTM1Q6UX27 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
VSTM1Q6UX27 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
VSTM1Q6UX27 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
VSTM1Q6UX27 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
VSTM1Q6UX27 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
VSTM1Q6UX27 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
VSTM1Q6UX27 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
VSTM1Q6UX27 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
VSTM1Q6UX27 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
VSTM1Q6UX27 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
VSTM1Q6UX27 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms