Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2Q9

PRPF8, Pre-mRNA-processing-splicing factor 8, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 2,335 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF8Q6P2Q9 FLNB-201ENST00000295956 9463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.93e-12■■■■■ 31.2
PRPF8Q6P2Q9 FLNB-212ENST00000490882 8079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.073e-12■■■■■ 31.2
PRPF8Q6P2Q9 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.132e-8■■■■■ 31.2
PRPF8Q6P2Q9 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.132e-8■■■■■ 31.2
PRPF8Q6P2Q9 BANP-218ENST00000481948 1730 ntTSL 1 (best)11.82□□□□□ -0.529e-8■■■■■ 31.2
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PRPF8Q6P2Q9 VPS13A-203ENST00000360280 15320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.29e-7■■■■■ 31.2
PRPF8Q6P2Q9 VPS13A-202ENST00000357409 9967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.529e-7■■■■■ 31.2
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PRPF8Q6P2Q9 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.216e-10■■■■■ 31.2
PRPF8Q6P2Q9 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.96e-10■■■■■ 31.2
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PRPF8Q6P2Q9 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.56e-10■■■■■ 31.2
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PRPF8Q6P2Q9 LONP2-208ENST00000566755 2514 ntTSL 59.14□□□□□ -0.951e-6■■■■■ 31.2
PRPF8Q6P2Q9 LONP2-201ENST00000285737 8199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.951e-6■■■■■ 31.2
PRPF8Q6P2Q9 SMG7-214ENST00000508461 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.716e-7■■■■■ 31.2
PRPF8Q6P2Q9 SMG7-212ENST00000507469 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.936e-7■■■■■ 31.2
PRPF8Q6P2Q9 SMG7-201ENST00000347615 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.066e-7■■■■■ 31.2
PRPF8Q6P2Q9 SMG7-215ENST00000515829 5629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.16e-7■■■■■ 31.2
PRPF8Q6P2Q9 SMG7-202ENST00000367537 5970 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.256e-7■■■■■ 31.2
PRPF8Q6P2Q9 TBC1D4-207ENST00000493487 458 ntTSL 41.97□□□□□ -2.098e-7■■■■■ 31.1
PRPF8Q6P2Q9 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.022e-10■■■■■ 31.1
PRPF8Q6P2Q9 STMN3-205ENST00000634126 605 ntTSL 37.92□□□□□ -1.142e-10■■■■■ 31.1
PRPF8Q6P2Q9 UBR4-212ENST00000475973 600 ntTSL 35.11□□□□□ -1.592e-12■■■■■ 31.1
PRPF8Q6P2Q9 PABPC4-223ENST00000529216 317 ntTSL 56.55□□□□□ -1.363e-11■■■■■ 31.1
PRPF8Q6P2Q9 RPL17-219ENST00000584364 523 ntTSL 23.98□□□□□ -1.771e-8■■■■■ 31.1
PRPF8Q6P2Q9 RPL17-214ENST00000582588 401 ntTSL 21.17□□□□□ -2.222e-8■■■■■ 31.1
PRPF8Q6P2Q9 MAN2A2-202ENST00000557865 2671 ntTSL 29.56□□□□□ -0.886e-7■■■■■ 31.1
PRPF8Q6P2Q9 RAB3GAP1-202ENST00000425393 1139 ntTSL 2 BASIC1.27□□□□□ -2.219e-7■■■■■ 31.1
PRPF8Q6P2Q9 SEC16B-208ENST00000528461 3277 ntTSL 1 (best)10.54□□□□□ -0.724e-7■■■■■ 31.1
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PRPF8Q6P2Q9 AL359075.2-202ENST00000466953 6212 ntTSL 27.67□□□□□ -1.184e-7■■■■■ 31.1
PRPF8Q6P2Q9 SEC16B-201ENST00000308284 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.24e-7■■■■■ 31.1
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