Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1Q0

LETMD1, LETM1 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETMD1Q6P1Q0 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LETMD1Q6P1Q0 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LETMD1Q6P1Q0 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LETMD1Q6P1Q0 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LETMD1Q6P1Q0 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LETMD1Q6P1Q0 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LETMD1Q6P1Q0 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LETMD1Q6P1Q0 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LETMD1Q6P1Q0 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
LETMD1Q6P1Q0 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LETMD1Q6P1Q0 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LETMD1Q6P1Q0 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LETMD1Q6P1Q0 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LETMD1Q6P1Q0 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LETMD1Q6P1Q0 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LETMD1Q6P1Q0 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LETMD1Q6P1Q0 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LETMD1Q6P1Q0 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LETMD1Q6P1Q0 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LETMD1Q6P1Q0 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LETMD1Q6P1Q0 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LETMD1Q6P1Q0 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LETMD1Q6P1Q0 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LETMD1Q6P1Q0 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LETMD1Q6P1Q0 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LETMD1Q6P1Q0 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LETMD1Q6P1Q0 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LETMD1Q6P1Q0 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LETMD1Q6P1Q0 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LETMD1Q6P1Q0 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LETMD1Q6P1Q0 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LETMD1Q6P1Q0 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LETMD1Q6P1Q0 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LETMD1Q6P1Q0 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LETMD1Q6P1Q0 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LETMD1Q6P1Q0 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LETMD1Q6P1Q0 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LETMD1Q6P1Q0 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LETMD1Q6P1Q0 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LETMD1Q6P1Q0 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LETMD1Q6P1Q0 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LETMD1Q6P1Q0 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LETMD1Q6P1Q0 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LETMD1Q6P1Q0 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LETMD1Q6P1Q0 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LETMD1Q6P1Q0 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LETMD1Q6P1Q0 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LETMD1Q6P1Q0 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LETMD1Q6P1Q0 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LETMD1Q6P1Q0 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LETMD1Q6P1Q0 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LETMD1Q6P1Q0 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
LETMD1Q6P1Q0 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
LETMD1Q6P1Q0 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LETMD1Q6P1Q0 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LETMD1Q6P1Q0 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LETMD1Q6P1Q0 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LETMD1Q6P1Q0 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LETMD1Q6P1Q0 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LETMD1Q6P1Q0 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
LETMD1Q6P1Q0 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LETMD1Q6P1Q0 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LETMD1Q6P1Q0 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LETMD1Q6P1Q0 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LETMD1Q6P1Q0 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LETMD1Q6P1Q0 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LETMD1Q6P1Q0 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LETMD1Q6P1Q0 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LETMD1Q6P1Q0 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LETMD1Q6P1Q0 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LETMD1Q6P1Q0 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LETMD1Q6P1Q0 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LETMD1Q6P1Q0 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LETMD1Q6P1Q0 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LETMD1Q6P1Q0 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LETMD1Q6P1Q0 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LETMD1Q6P1Q0 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LETMD1Q6P1Q0 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LETMD1Q6P1Q0 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LETMD1Q6P1Q0 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LETMD1Q6P1Q0 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LETMD1Q6P1Q0 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LETMD1Q6P1Q0 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LETMD1Q6P1Q0 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LETMD1Q6P1Q0 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LETMD1Q6P1Q0 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LETMD1Q6P1Q0 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LETMD1Q6P1Q0 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
LETMD1Q6P1Q0 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LETMD1Q6P1Q0 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LETMD1Q6P1Q0 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LETMD1Q6P1Q0 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LETMD1Q6P1Q0 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LETMD1Q6P1Q0 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LETMD1Q6P1Q0 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LETMD1Q6P1Q0 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LETMD1Q6P1Q0 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LETMD1Q6P1Q0 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LETMD1Q6P1Q0 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LETMD1Q6P1Q0 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms