Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT03

NUTM2D, NUT family member 2D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUTM2DQ5VT03 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NUTM2DQ5VT03 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NUTM2DQ5VT03 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NUTM2DQ5VT03 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NUTM2DQ5VT03 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NUTM2DQ5VT03 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NUTM2DQ5VT03 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NUTM2DQ5VT03 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NUTM2DQ5VT03 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NUTM2DQ5VT03 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NUTM2DQ5VT03 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NUTM2DQ5VT03 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NUTM2DQ5VT03 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NUTM2DQ5VT03 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NUTM2DQ5VT03 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NUTM2DQ5VT03 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NUTM2DQ5VT03 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NUTM2DQ5VT03 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NUTM2DQ5VT03 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NUTM2DQ5VT03 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NUTM2DQ5VT03 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NUTM2DQ5VT03 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NUTM2DQ5VT03 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NUTM2DQ5VT03 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
NUTM2DQ5VT03 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NUTM2DQ5VT03 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NUTM2DQ5VT03 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NUTM2DQ5VT03 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NUTM2DQ5VT03 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
NUTM2DQ5VT03 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NUTM2DQ5VT03 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NUTM2DQ5VT03 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NUTM2DQ5VT03 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NUTM2DQ5VT03 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NUTM2DQ5VT03 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NUTM2DQ5VT03 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NUTM2DQ5VT03 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NUTM2DQ5VT03 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NUTM2DQ5VT03 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NUTM2DQ5VT03 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NUTM2DQ5VT03 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NUTM2DQ5VT03 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NUTM2DQ5VT03 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NUTM2DQ5VT03 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NUTM2DQ5VT03 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
NUTM2DQ5VT03 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NUTM2DQ5VT03 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NUTM2DQ5VT03 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NUTM2DQ5VT03 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
NUTM2DQ5VT03 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
NUTM2DQ5VT03 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NUTM2DQ5VT03 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NUTM2DQ5VT03 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NUTM2DQ5VT03 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NUTM2DQ5VT03 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NUTM2DQ5VT03 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NUTM2DQ5VT03 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NUTM2DQ5VT03 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NUTM2DQ5VT03 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NUTM2DQ5VT03 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NUTM2DQ5VT03 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NUTM2DQ5VT03 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
NUTM2DQ5VT03 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NUTM2DQ5VT03 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NUTM2DQ5VT03 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
NUTM2DQ5VT03 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NUTM2DQ5VT03 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NUTM2DQ5VT03 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NUTM2DQ5VT03 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NUTM2DQ5VT03 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NUTM2DQ5VT03 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NUTM2DQ5VT03 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NUTM2DQ5VT03 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NUTM2DQ5VT03 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
NUTM2DQ5VT03 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NUTM2DQ5VT03 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NUTM2DQ5VT03 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NUTM2DQ5VT03 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NUTM2DQ5VT03 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NUTM2DQ5VT03 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
NUTM2DQ5VT03 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NUTM2DQ5VT03 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NUTM2DQ5VT03 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NUTM2DQ5VT03 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NUTM2DQ5VT03 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NUTM2DQ5VT03 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
NUTM2DQ5VT03 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NUTM2DQ5VT03 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
NUTM2DQ5VT03 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NUTM2DQ5VT03 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NUTM2DQ5VT03 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NUTM2DQ5VT03 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NUTM2DQ5VT03 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NUTM2DQ5VT03 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NUTM2DQ5VT03 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NUTM2DQ5VT03 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NUTM2DQ5VT03 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NUTM2DQ5VT03 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NUTM2DQ5VT03 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NUTM2DQ5VT03 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms