Protein–RNA interactions for Protein: Q53GT1

KLHL22, Kelch-like protein 22, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL22Q53GT1 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL22Q53GT1 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL22Q53GT1 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL22Q53GT1 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL22Q53GT1 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL22Q53GT1 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL22Q53GT1 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL22Q53GT1 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL22Q53GT1 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL22Q53GT1 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL22Q53GT1 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL22Q53GT1 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL22Q53GT1 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL22Q53GT1 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL22Q53GT1 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL22Q53GT1 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL22Q53GT1 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL22Q53GT1 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL22Q53GT1 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL22Q53GT1 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL22Q53GT1 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL22Q53GT1 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL22Q53GT1 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLHL22Q53GT1 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL22Q53GT1 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL22Q53GT1 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL22Q53GT1 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL22Q53GT1 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL22Q53GT1 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL22Q53GT1 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL22Q53GT1 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL22Q53GT1 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL22Q53GT1 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL22Q53GT1 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL22Q53GT1 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL22Q53GT1 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL22Q53GT1 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL22Q53GT1 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL22Q53GT1 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL22Q53GT1 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL22Q53GT1 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL22Q53GT1 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL22Q53GT1 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL22Q53GT1 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL22Q53GT1 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL22Q53GT1 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL22Q53GT1 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL22Q53GT1 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL22Q53GT1 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL22Q53GT1 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL22Q53GT1 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL22Q53GT1 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL22Q53GT1 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL22Q53GT1 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL22Q53GT1 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL22Q53GT1 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL22Q53GT1 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL22Q53GT1 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL22Q53GT1 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL22Q53GT1 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL22Q53GT1 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL22Q53GT1 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL22Q53GT1 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL22Q53GT1 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL22Q53GT1 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL22Q53GT1 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL22Q53GT1 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL22Q53GT1 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL22Q53GT1 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL22Q53GT1 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL22Q53GT1 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL22Q53GT1 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL22Q53GT1 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL22Q53GT1 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL22Q53GT1 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL22Q53GT1 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL22Q53GT1 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL22Q53GT1 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL22Q53GT1 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL22Q53GT1 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL22Q53GT1 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL22Q53GT1 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL22Q53GT1 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL22Q53GT1 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL22Q53GT1 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL22Q53GT1 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL22Q53GT1 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL22Q53GT1 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL22Q53GT1 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL22Q53GT1 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL22Q53GT1 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL22Q53GT1 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL22Q53GT1 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL22Q53GT1 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL22Q53GT1 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL22Q53GT1 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL22Q53GT1 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL22Q53GT1 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL22Q53GT1 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
KLHL22Q53GT1 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms