Protein–RNA interactions for Protein: Q502W7

CCDC38, Coiled-coil domain-containing protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC38Q502W7 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC38Q502W7 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC38Q502W7 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC38Q502W7 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC38Q502W7 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC38Q502W7 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC38Q502W7 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC38Q502W7 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC38Q502W7 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC38Q502W7 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC38Q502W7 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC38Q502W7 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC38Q502W7 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC38Q502W7 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC38Q502W7 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC38Q502W7 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC38Q502W7 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC38Q502W7 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC38Q502W7 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC38Q502W7 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC38Q502W7 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC38Q502W7 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC38Q502W7 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC38Q502W7 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC38Q502W7 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC38Q502W7 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC38Q502W7 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC38Q502W7 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC38Q502W7 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC38Q502W7 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC38Q502W7 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC38Q502W7 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC38Q502W7 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC38Q502W7 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC38Q502W7 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC38Q502W7 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC38Q502W7 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC38Q502W7 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC38Q502W7 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC38Q502W7 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC38Q502W7 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC38Q502W7 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC38Q502W7 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC38Q502W7 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC38Q502W7 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC38Q502W7 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC38Q502W7 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC38Q502W7 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC38Q502W7 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC38Q502W7 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC38Q502W7 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC38Q502W7 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC38Q502W7 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC38Q502W7 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC38Q502W7 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC38Q502W7 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC38Q502W7 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC38Q502W7 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC38Q502W7 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC38Q502W7 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC38Q502W7 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC38Q502W7 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC38Q502W7 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC38Q502W7 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC38Q502W7 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC38Q502W7 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC38Q502W7 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC38Q502W7 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC38Q502W7 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC38Q502W7 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC38Q502W7 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC38Q502W7 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
CCDC38Q502W7 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCDC38Q502W7 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCDC38Q502W7 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCDC38Q502W7 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCDC38Q502W7 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCDC38Q502W7 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCDC38Q502W7 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC38Q502W7 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC38Q502W7 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC38Q502W7 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC38Q502W7 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC38Q502W7 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC38Q502W7 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC38Q502W7 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC38Q502W7 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC38Q502W7 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC38Q502W7 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC38Q502W7 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC38Q502W7 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC38Q502W7 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC38Q502W7 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC38Q502W7 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC38Q502W7 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC38Q502W7 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC38Q502W7 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC38Q502W7 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC38Q502W7 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC38Q502W7 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms