Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY56

SP6, Transcription factor Sp6, humanhuman

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Length 376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP6Q3SY56 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SP6Q3SY56 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SP6Q3SY56 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
SP6Q3SY56 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SP6Q3SY56 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SP6Q3SY56 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SP6Q3SY56 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SP6Q3SY56 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SP6Q3SY56 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SP6Q3SY56 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SP6Q3SY56 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SP6Q3SY56 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SP6Q3SY56 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SP6Q3SY56 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SP6Q3SY56 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SP6Q3SY56 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SP6Q3SY56 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SP6Q3SY56 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SP6Q3SY56 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SP6Q3SY56 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SP6Q3SY56 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SP6Q3SY56 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SP6Q3SY56 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SP6Q3SY56 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
SP6Q3SY56 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SP6Q3SY56 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SP6Q3SY56 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SP6Q3SY56 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SP6Q3SY56 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SP6Q3SY56 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
SP6Q3SY56 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SP6Q3SY56 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SP6Q3SY56 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SP6Q3SY56 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SP6Q3SY56 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SP6Q3SY56 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SP6Q3SY56 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SP6Q3SY56 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SP6Q3SY56 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SP6Q3SY56 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SP6Q3SY56 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SP6Q3SY56 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SP6Q3SY56 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SP6Q3SY56 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SP6Q3SY56 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SP6Q3SY56 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SP6Q3SY56 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SP6Q3SY56 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SP6Q3SY56 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
SP6Q3SY56 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SP6Q3SY56 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SP6Q3SY56 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SP6Q3SY56 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SP6Q3SY56 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SP6Q3SY56 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SP6Q3SY56 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SP6Q3SY56 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SP6Q3SY56 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SP6Q3SY56 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SP6Q3SY56 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SP6Q3SY56 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SP6Q3SY56 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SP6Q3SY56 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SP6Q3SY56 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SP6Q3SY56 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SP6Q3SY56 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SP6Q3SY56 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SP6Q3SY56 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SP6Q3SY56 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SP6Q3SY56 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SP6Q3SY56 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SP6Q3SY56 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
SP6Q3SY56 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SP6Q3SY56 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
SP6Q3SY56 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SP6Q3SY56 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SP6Q3SY56 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SP6Q3SY56 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SP6Q3SY56 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SP6Q3SY56 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SP6Q3SY56 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SP6Q3SY56 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SP6Q3SY56 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SP6Q3SY56 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SP6Q3SY56 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SP6Q3SY56 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SP6Q3SY56 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SP6Q3SY56 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SP6Q3SY56 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SP6Q3SY56 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SP6Q3SY56 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SP6Q3SY56 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SP6Q3SY56 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SP6Q3SY56 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SP6Q3SY56 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SP6Q3SY56 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SP6Q3SY56 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SP6Q3SY56 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SP6Q3SY56 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SP6Q3SY56 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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