Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RTL8BQ17RB0 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RTL8BQ17RB0 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RTL8BQ17RB0 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RTL8BQ17RB0 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RTL8BQ17RB0 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
RTL8BQ17RB0 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
RTL8BQ17RB0 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RTL8BQ17RB0 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RTL8BQ17RB0 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RTL8BQ17RB0 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RTL8BQ17RB0 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RTL8BQ17RB0 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RTL8BQ17RB0 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RTL8BQ17RB0 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RTL8BQ17RB0 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RTL8BQ17RB0 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RTL8BQ17RB0 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RTL8BQ17RB0 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RTL8BQ17RB0 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RTL8BQ17RB0 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RTL8BQ17RB0 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RTL8BQ17RB0 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RTL8BQ17RB0 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RTL8BQ17RB0 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RTL8BQ17RB0 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RTL8BQ17RB0 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RTL8BQ17RB0 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RTL8BQ17RB0 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RTL8BQ17RB0 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RTL8BQ17RB0 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RTL8BQ17RB0 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RTL8BQ17RB0 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RTL8BQ17RB0 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RTL8BQ17RB0 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
RTL8BQ17RB0 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RTL8BQ17RB0 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RTL8BQ17RB0 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RTL8BQ17RB0 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RTL8BQ17RB0 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RTL8BQ17RB0 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RTL8BQ17RB0 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RTL8BQ17RB0 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RTL8BQ17RB0 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RTL8BQ17RB0 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RTL8BQ17RB0 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RTL8BQ17RB0 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RTL8BQ17RB0 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RTL8BQ17RB0 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RTL8BQ17RB0 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
RTL8BQ17RB0 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RTL8BQ17RB0 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RTL8BQ17RB0 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RTL8BQ17RB0 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RTL8BQ17RB0 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RTL8BQ17RB0 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RTL8BQ17RB0 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RTL8BQ17RB0 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RTL8BQ17RB0 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RTL8BQ17RB0 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RTL8BQ17RB0 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RTL8BQ17RB0 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RTL8BQ17RB0 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RTL8BQ17RB0 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RTL8BQ17RB0 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RTL8BQ17RB0 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RTL8BQ17RB0 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RTL8BQ17RB0 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RTL8BQ17RB0 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RTL8BQ17RB0 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RTL8BQ17RB0 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RTL8BQ17RB0 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RTL8BQ17RB0 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RTL8BQ17RB0 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RTL8BQ17RB0 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RTL8BQ17RB0 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RTL8BQ17RB0 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RTL8BQ17RB0 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RTL8BQ17RB0 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RTL8BQ17RB0 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RTL8BQ17RB0 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RTL8BQ17RB0 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RTL8BQ17RB0 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
RTL8BQ17RB0 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RTL8BQ17RB0 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RTL8BQ17RB0 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RTL8BQ17RB0 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RTL8BQ17RB0 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RTL8BQ17RB0 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RTL8BQ17RB0 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RTL8BQ17RB0 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RTL8BQ17RB0 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RTL8BQ17RB0 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RTL8BQ17RB0 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RTL8BQ17RB0 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RTL8BQ17RB0 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RTL8BQ17RB0 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RTL8BQ17RB0 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RTL8BQ17RB0 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RTL8BQ17RB0 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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