Protein–RNA interactions for Protein: Q16363

LAMA4, Laminin subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,823 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA4Q16363 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
LAMA4Q16363 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
LAMA4Q16363 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
LAMA4Q16363 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
LAMA4Q16363 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
LAMA4Q16363 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LAMA4Q16363 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LAMA4Q16363 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
LAMA4Q16363 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
LAMA4Q16363 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
LAMA4Q16363 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
LAMA4Q16363 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LAMA4Q16363 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
LAMA4Q16363 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
LAMA4Q16363 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LAMA4Q16363 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
LAMA4Q16363 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
LAMA4Q16363 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LAMA4Q16363 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LAMA4Q16363 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
LAMA4Q16363 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LAMA4Q16363 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LAMA4Q16363 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LAMA4Q16363 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
LAMA4Q16363 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
LAMA4Q16363 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
LAMA4Q16363 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LAMA4Q16363 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
LAMA4Q16363 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC20.94■□□□□ 0.94
LAMA4Q16363 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
LAMA4Q16363 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
LAMA4Q16363 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LAMA4Q16363 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LAMA4Q16363 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
LAMA4Q16363 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
LAMA4Q16363 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
LAMA4Q16363 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
LAMA4Q16363 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
LAMA4Q16363 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
LAMA4Q16363 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC20.93■□□□□ 0.94
LAMA4Q16363 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
LAMA4Q16363 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
LAMA4Q16363 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
LAMA4Q16363 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
LAMA4Q16363 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
LAMA4Q16363 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
LAMA4Q16363 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
LAMA4Q16363 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
LAMA4Q16363 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
LAMA4Q16363 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
LAMA4Q16363 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
LAMA4Q16363 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
LAMA4Q16363 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
LAMA4Q16363 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
LAMA4Q16363 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
LAMA4Q16363 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
LAMA4Q16363 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
LAMA4Q16363 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
LAMA4Q16363 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
LAMA4Q16363 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
LAMA4Q16363 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
LAMA4Q16363 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
LAMA4Q16363 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
LAMA4Q16363 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
LAMA4Q16363 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
LAMA4Q16363 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
LAMA4Q16363 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
LAMA4Q16363 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
LAMA4Q16363 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
LAMA4Q16363 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
LAMA4Q16363 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
LAMA4Q16363 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
LAMA4Q16363 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
LAMA4Q16363 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
LAMA4Q16363 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
LAMA4Q16363 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
LAMA4Q16363 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
LAMA4Q16363 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
LAMA4Q16363 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
LAMA4Q16363 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC20.92■□□□□ 0.94
LAMA4Q16363 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC20.92■□□□□ 0.94
LAMA4Q16363 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
LAMA4Q16363 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC20.92■□□□□ 0.94
LAMA4Q16363 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
LAMA4Q16363 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
LAMA4Q16363 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
LAMA4Q16363 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
LAMA4Q16363 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
LAMA4Q16363 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
LAMA4Q16363 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
LAMA4Q16363 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
LAMA4Q16363 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
LAMA4Q16363 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
LAMA4Q16363 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
LAMA4Q16363 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
LAMA4Q16363 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
LAMA4Q16363 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
LAMA4Q16363 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
LAMA4Q16363 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
LAMA4Q16363 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
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