Protein–RNA interactions for Protein: Q15699

ALX1, ALX homeobox protein 1, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALX1Q15699 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ALX1Q15699 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ALX1Q15699 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ALX1Q15699 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ALX1Q15699 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ALX1Q15699 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ALX1Q15699 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ALX1Q15699 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ALX1Q15699 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ALX1Q15699 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ALX1Q15699 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ALX1Q15699 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ALX1Q15699 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
ALX1Q15699 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ALX1Q15699 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ALX1Q15699 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ALX1Q15699 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ALX1Q15699 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
ALX1Q15699 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ALX1Q15699 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ALX1Q15699 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
ALX1Q15699 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ALX1Q15699 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ALX1Q15699 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
ALX1Q15699 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ALX1Q15699 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ALX1Q15699 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ALX1Q15699 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ALX1Q15699 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
ALX1Q15699 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
ALX1Q15699 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
ALX1Q15699 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
ALX1Q15699 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC21.02■□□□□ 0.95
ALX1Q15699 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
ALX1Q15699 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ALX1Q15699 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ALX1Q15699 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ALX1Q15699 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ALX1Q15699 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ALX1Q15699 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
ALX1Q15699 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ALX1Q15699 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
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ALX1Q15699 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ALX1Q15699 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ALX1Q15699 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ALX1Q15699 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ALX1Q15699 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
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ALX1Q15699 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
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ALX1Q15699 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC21.01■□□□□ 0.95
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ALX1Q15699 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ALX1Q15699 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ALX1Q15699 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ALX1Q15699 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
ALX1Q15699 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ALX1Q15699 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
ALX1Q15699 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ALX1Q15699 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ALX1Q15699 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ALX1Q15699 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ALX1Q15699 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ALX1Q15699 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
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ALX1Q15699 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
ALX1Q15699 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC21■□□□□ 0.95
ALX1Q15699 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC21■□□□□ 0.95
ALX1Q15699 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
ALX1Q15699 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ALX1Q15699 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ALX1Q15699 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
ALX1Q15699 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
ALX1Q15699 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
ALX1Q15699 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ALX1Q15699 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ALX1Q15699 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ALX1Q15699 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
ALX1Q15699 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ALX1Q15699 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ALX1Q15699 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ALX1Q15699 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ALX1Q15699 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ALX1Q15699 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ALX1Q15699 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
ALX1Q15699 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ALX1Q15699 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ALX1Q15699 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ALX1Q15699 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ALX1Q15699 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ALX1Q15699 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ALX1Q15699 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ALX1Q15699 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
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