Protein–RNA interactions for Protein: Q15120

PDK3, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK3Q15120 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PDK3Q15120 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PDK3Q15120 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PDK3Q15120 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PDK3Q15120 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PDK3Q15120 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PDK3Q15120 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PDK3Q15120 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PDK3Q15120 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PDK3Q15120 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PDK3Q15120 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PDK3Q15120 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PDK3Q15120 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PDK3Q15120 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PDK3Q15120 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PDK3Q15120 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PDK3Q15120 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PDK3Q15120 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PDK3Q15120 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PDK3Q15120 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PDK3Q15120 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PDK3Q15120 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PDK3Q15120 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PDK3Q15120 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PDK3Q15120 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PDK3Q15120 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PDK3Q15120 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PDK3Q15120 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PDK3Q15120 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PDK3Q15120 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PDK3Q15120 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PDK3Q15120 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PDK3Q15120 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PDK3Q15120 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PDK3Q15120 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PDK3Q15120 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PDK3Q15120 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PDK3Q15120 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PDK3Q15120 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PDK3Q15120 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PDK3Q15120 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PDK3Q15120 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PDK3Q15120 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PDK3Q15120 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PDK3Q15120 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PDK3Q15120 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PDK3Q15120 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PDK3Q15120 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PDK3Q15120 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PDK3Q15120 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PDK3Q15120 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PDK3Q15120 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PDK3Q15120 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PDK3Q15120 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PDK3Q15120 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PDK3Q15120 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PDK3Q15120 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PDK3Q15120 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PDK3Q15120 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PDK3Q15120 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PDK3Q15120 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PDK3Q15120 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PDK3Q15120 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PDK3Q15120 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PDK3Q15120 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PDK3Q15120 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PDK3Q15120 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PDK3Q15120 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PDK3Q15120 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PDK3Q15120 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PDK3Q15120 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PDK3Q15120 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PDK3Q15120 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PDK3Q15120 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PDK3Q15120 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PDK3Q15120 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PDK3Q15120 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PDK3Q15120 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PDK3Q15120 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PDK3Q15120 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PDK3Q15120 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PDK3Q15120 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
PDK3Q15120 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
PDK3Q15120 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
PDK3Q15120 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PDK3Q15120 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PDK3Q15120 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PDK3Q15120 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
PDK3Q15120 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PDK3Q15120 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PDK3Q15120 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PDK3Q15120 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PDK3Q15120 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PDK3Q15120 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
PDK3Q15120 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PDK3Q15120 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PDK3Q15120 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PDK3Q15120 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PDK3Q15120 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PDK3Q15120 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms