Protein–RNA interactions for Protein: Q15004

PCLAF, PCNA-associated factor, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCLAFQ15004 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PCLAFQ15004 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PCLAFQ15004 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PCLAFQ15004 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PCLAFQ15004 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PCLAFQ15004 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PCLAFQ15004 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PCLAFQ15004 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PCLAFQ15004 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PCLAFQ15004 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PCLAFQ15004 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PCLAFQ15004 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PCLAFQ15004 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PCLAFQ15004 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PCLAFQ15004 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PCLAFQ15004 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PCLAFQ15004 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PCLAFQ15004 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PCLAFQ15004 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PCLAFQ15004 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PCLAFQ15004 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PCLAFQ15004 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PCLAFQ15004 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PCLAFQ15004 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PCLAFQ15004 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PCLAFQ15004 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PCLAFQ15004 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PCLAFQ15004 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PCLAFQ15004 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PCLAFQ15004 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PCLAFQ15004 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PCLAFQ15004 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PCLAFQ15004 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PCLAFQ15004 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PCLAFQ15004 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PCLAFQ15004 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PCLAFQ15004 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PCLAFQ15004 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PCLAFQ15004 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PCLAFQ15004 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PCLAFQ15004 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PCLAFQ15004 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PCLAFQ15004 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PCLAFQ15004 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PCLAFQ15004 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PCLAFQ15004 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PCLAFQ15004 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PCLAFQ15004 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PCLAFQ15004 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PCLAFQ15004 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PCLAFQ15004 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PCLAFQ15004 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PCLAFQ15004 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PCLAFQ15004 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PCLAFQ15004 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PCLAFQ15004 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PCLAFQ15004 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PCLAFQ15004 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PCLAFQ15004 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PCLAFQ15004 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
PCLAFQ15004 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PCLAFQ15004 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PCLAFQ15004 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PCLAFQ15004 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
PCLAFQ15004 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PCLAFQ15004 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PCLAFQ15004 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
PCLAFQ15004 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PCLAFQ15004 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PCLAFQ15004 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PCLAFQ15004 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PCLAFQ15004 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PCLAFQ15004 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PCLAFQ15004 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PCLAFQ15004 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PCLAFQ15004 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
PCLAFQ15004 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PCLAFQ15004 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PCLAFQ15004 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PCLAFQ15004 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PCLAFQ15004 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PCLAFQ15004 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PCLAFQ15004 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PCLAFQ15004 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PCLAFQ15004 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PCLAFQ15004 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PCLAFQ15004 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PCLAFQ15004 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PCLAFQ15004 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PCLAFQ15004 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PCLAFQ15004 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
PCLAFQ15004 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PCLAFQ15004 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PCLAFQ15004 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PCLAFQ15004 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PCLAFQ15004 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PCLAFQ15004 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
PCLAFQ15004 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PCLAFQ15004 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PCLAFQ15004 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
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