Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RFTN1Q14699 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
RFTN1Q14699 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RFTN1Q14699 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RFTN1Q14699 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RFTN1Q14699 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
RFTN1Q14699 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RFTN1Q14699 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RFTN1Q14699 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RFTN1Q14699 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
RFTN1Q14699 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RFTN1Q14699 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RFTN1Q14699 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RFTN1Q14699 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RFTN1Q14699 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RFTN1Q14699 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RFTN1Q14699 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RFTN1Q14699 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RFTN1Q14699 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RFTN1Q14699 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RFTN1Q14699 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RFTN1Q14699 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RFTN1Q14699 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RFTN1Q14699 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RFTN1Q14699 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RFTN1Q14699 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RFTN1Q14699 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
RFTN1Q14699 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RFTN1Q14699 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RFTN1Q14699 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RFTN1Q14699 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
RFTN1Q14699 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RFTN1Q14699 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RFTN1Q14699 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RFTN1Q14699 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RFTN1Q14699 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RFTN1Q14699 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RFTN1Q14699 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RFTN1Q14699 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RFTN1Q14699 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RFTN1Q14699 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
RFTN1Q14699 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RFTN1Q14699 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RFTN1Q14699 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RFTN1Q14699 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RFTN1Q14699 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RFTN1Q14699 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
RFTN1Q14699 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RFTN1Q14699 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RFTN1Q14699 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RFTN1Q14699 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RFTN1Q14699 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RFTN1Q14699 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RFTN1Q14699 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RFTN1Q14699 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RFTN1Q14699 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RFTN1Q14699 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RFTN1Q14699 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RFTN1Q14699 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
RFTN1Q14699 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RFTN1Q14699 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RFTN1Q14699 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RFTN1Q14699 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RFTN1Q14699 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RFTN1Q14699 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RFTN1Q14699 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
RFTN1Q14699 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
RFTN1Q14699 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
RFTN1Q14699 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
RFTN1Q14699 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
RFTN1Q14699 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RFTN1Q14699 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RFTN1Q14699 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RFTN1Q14699 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RFTN1Q14699 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RFTN1Q14699 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RFTN1Q14699 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RFTN1Q14699 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RFTN1Q14699 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RFTN1Q14699 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RFTN1Q14699 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RFTN1Q14699 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RFTN1Q14699 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
RFTN1Q14699 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
RFTN1Q14699 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RFTN1Q14699 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
RFTN1Q14699 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RFTN1Q14699 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
RFTN1Q14699 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RFTN1Q14699 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RFTN1Q14699 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RFTN1Q14699 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RFTN1Q14699 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RFTN1Q14699 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RFTN1Q14699 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RFTN1Q14699 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RFTN1Q14699 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RFTN1Q14699 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RFTN1Q14699 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RFTN1Q14699 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
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