Protein–RNA interactions for Protein: Q14534

SQLE, Squalene monooxygenase, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SQLEQ14534 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SQLEQ14534 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SQLEQ14534 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SQLEQ14534 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SQLEQ14534 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SQLEQ14534 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SQLEQ14534 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SQLEQ14534 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SQLEQ14534 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SQLEQ14534 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SQLEQ14534 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SQLEQ14534 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SQLEQ14534 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SQLEQ14534 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SQLEQ14534 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SQLEQ14534 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SQLEQ14534 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SQLEQ14534 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SQLEQ14534 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SQLEQ14534 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SQLEQ14534 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SQLEQ14534 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SQLEQ14534 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SQLEQ14534 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SQLEQ14534 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SQLEQ14534 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SQLEQ14534 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SQLEQ14534 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SQLEQ14534 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SQLEQ14534 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SQLEQ14534 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SQLEQ14534 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SQLEQ14534 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SQLEQ14534 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SQLEQ14534 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SQLEQ14534 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SQLEQ14534 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SQLEQ14534 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SQLEQ14534 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SQLEQ14534 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SQLEQ14534 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SQLEQ14534 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SQLEQ14534 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SQLEQ14534 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SQLEQ14534 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SQLEQ14534 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SQLEQ14534 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SQLEQ14534 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SQLEQ14534 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SQLEQ14534 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SQLEQ14534 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SQLEQ14534 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SQLEQ14534 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SQLEQ14534 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SQLEQ14534 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SQLEQ14534 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SQLEQ14534 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SQLEQ14534 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SQLEQ14534 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SQLEQ14534 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SQLEQ14534 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SQLEQ14534 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SQLEQ14534 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SQLEQ14534 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SQLEQ14534 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SQLEQ14534 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SQLEQ14534 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SQLEQ14534 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SQLEQ14534 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SQLEQ14534 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SQLEQ14534 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SQLEQ14534 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SQLEQ14534 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SQLEQ14534 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SQLEQ14534 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SQLEQ14534 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SQLEQ14534 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SQLEQ14534 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SQLEQ14534 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SQLEQ14534 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SQLEQ14534 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SQLEQ14534 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SQLEQ14534 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SQLEQ14534 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SQLEQ14534 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SQLEQ14534 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SQLEQ14534 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SQLEQ14534 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SQLEQ14534 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SQLEQ14534 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SQLEQ14534 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SQLEQ14534 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
SQLEQ14534 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.34
SQLEQ14534 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SQLEQ14534 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SQLEQ14534 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SQLEQ14534 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SQLEQ14534 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SQLEQ14534 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SQLEQ14534 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
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