Protein–RNA interactions for Protein: Q14247

CTTN, Src substrate cortactin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTNQ14247 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CTTNQ14247 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CTTNQ14247 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CTTNQ14247 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CTTNQ14247 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CTTNQ14247 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CTTNQ14247 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CTTNQ14247 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CTTNQ14247 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CTTNQ14247 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CTTNQ14247 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CTTNQ14247 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CTTNQ14247 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CTTNQ14247 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
CTTNQ14247 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CTTNQ14247 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CTTNQ14247 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
CTTNQ14247 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CTTNQ14247 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CTTNQ14247 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CTTNQ14247 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CTTNQ14247 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CTTNQ14247 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CTTNQ14247 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CTTNQ14247 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CTTNQ14247 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CTTNQ14247 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CTTNQ14247 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CTTNQ14247 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CTTNQ14247 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CTTNQ14247 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CTTNQ14247 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CTTNQ14247 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CTTNQ14247 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTTNQ14247 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTTNQ14247 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTTNQ14247 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTTNQ14247 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTTNQ14247 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTTNQ14247 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTTNQ14247 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTTNQ14247 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
CTTNQ14247 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
CTTNQ14247 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
CTTNQ14247 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
CTTNQ14247 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
CTTNQ14247 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTTNQ14247 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTTNQ14247 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTTNQ14247 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTTNQ14247 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTTNQ14247 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTTNQ14247 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTTNQ14247 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTTNQ14247 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTTNQ14247 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTTNQ14247 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTTNQ14247 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTTNQ14247 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTTNQ14247 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTTNQ14247 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTTNQ14247 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTTNQ14247 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTTNQ14247 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTTNQ14247 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTTNQ14247 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTTNQ14247 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTTNQ14247 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTTNQ14247 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTTNQ14247 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTTNQ14247 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTTNQ14247 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTTNQ14247 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTTNQ14247 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTTNQ14247 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTTNQ14247 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTTNQ14247 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTTNQ14247 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTTNQ14247 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTTNQ14247 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTTNQ14247 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTTNQ14247 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTTNQ14247 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTTNQ14247 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
CTTNQ14247 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTTNQ14247 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTTNQ14247 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
CTTNQ14247 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
CTTNQ14247 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTTNQ14247 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTTNQ14247 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTTNQ14247 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTTNQ14247 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTTNQ14247 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTTNQ14247 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTTNQ14247 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTTNQ14247 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTTNQ14247 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CTTNQ14247 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CTTNQ14247 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms