Protein–RNA interactions for Protein: Q14108

SCARB2, Lysosome membrane protein 2, humanhuman

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Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARB2Q14108 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCARB2Q14108 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCARB2Q14108 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCARB2Q14108 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCARB2Q14108 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCARB2Q14108 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCARB2Q14108 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SCARB2Q14108 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCARB2Q14108 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCARB2Q14108 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCARB2Q14108 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCARB2Q14108 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCARB2Q14108 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCARB2Q14108 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCARB2Q14108 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCARB2Q14108 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCARB2Q14108 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCARB2Q14108 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCARB2Q14108 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCARB2Q14108 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SCARB2Q14108 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SCARB2Q14108 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCARB2Q14108 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCARB2Q14108 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SCARB2Q14108 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCARB2Q14108 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCARB2Q14108 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCARB2Q14108 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCARB2Q14108 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCARB2Q14108 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCARB2Q14108 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCARB2Q14108 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCARB2Q14108 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCARB2Q14108 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCARB2Q14108 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCARB2Q14108 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCARB2Q14108 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCARB2Q14108 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCARB2Q14108 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCARB2Q14108 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCARB2Q14108 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCARB2Q14108 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCARB2Q14108 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCARB2Q14108 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SCARB2Q14108 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCARB2Q14108 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCARB2Q14108 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SCARB2Q14108 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCARB2Q14108 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCARB2Q14108 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCARB2Q14108 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SCARB2Q14108 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCARB2Q14108 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCARB2Q14108 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCARB2Q14108 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SCARB2Q14108 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCARB2Q14108 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCARB2Q14108 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCARB2Q14108 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCARB2Q14108 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCARB2Q14108 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCARB2Q14108 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCARB2Q14108 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCARB2Q14108 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCARB2Q14108 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCARB2Q14108 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCARB2Q14108 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCARB2Q14108 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCARB2Q14108 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCARB2Q14108 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SCARB2Q14108 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SCARB2Q14108 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SCARB2Q14108 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SCARB2Q14108 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SCARB2Q14108 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SCARB2Q14108 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SCARB2Q14108 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SCARB2Q14108 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SCARB2Q14108 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SCARB2Q14108 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SCARB2Q14108 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SCARB2Q14108 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SCARB2Q14108 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SCARB2Q14108 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SCARB2Q14108 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SCARB2Q14108 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SCARB2Q14108 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SCARB2Q14108 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SCARB2Q14108 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SCARB2Q14108 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SCARB2Q14108 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SCARB2Q14108 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SCARB2Q14108 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SCARB2Q14108 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SCARB2Q14108 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SCARB2Q14108 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SCARB2Q14108 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SCARB2Q14108 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SCARB2Q14108 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SCARB2Q14108 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
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