Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

Predictions only

Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CACNA1SQ13698 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CACNA1SQ13698 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CACNA1SQ13698 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CACNA1SQ13698 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CACNA1SQ13698 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CACNA1SQ13698 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CACNA1SQ13698 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CACNA1SQ13698 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CACNA1SQ13698 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CACNA1SQ13698 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CACNA1SQ13698 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CACNA1SQ13698 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CACNA1SQ13698 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CACNA1SQ13698 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CACNA1SQ13698 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CACNA1SQ13698 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CACNA1SQ13698 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CACNA1SQ13698 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CACNA1SQ13698 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CACNA1SQ13698 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CACNA1SQ13698 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CACNA1SQ13698 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CACNA1SQ13698 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CACNA1SQ13698 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CACNA1SQ13698 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CACNA1SQ13698 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
CACNA1SQ13698 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.07
CACNA1SQ13698 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CACNA1SQ13698 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CACNA1SQ13698 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CACNA1SQ13698 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CACNA1SQ13698 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CACNA1SQ13698 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CACNA1SQ13698 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CACNA1SQ13698 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CACNA1SQ13698 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CACNA1SQ13698 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CACNA1SQ13698 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CACNA1SQ13698 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CACNA1SQ13698 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CACNA1SQ13698 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CACNA1SQ13698 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CACNA1SQ13698 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CACNA1SQ13698 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CACNA1SQ13698 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CACNA1SQ13698 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CACNA1SQ13698 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CACNA1SQ13698 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CACNA1SQ13698 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CACNA1SQ13698 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CACNA1SQ13698 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CACNA1SQ13698 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CACNA1SQ13698 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CACNA1SQ13698 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CACNA1SQ13698 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CACNA1SQ13698 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CACNA1SQ13698 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CACNA1SQ13698 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CACNA1SQ13698 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CACNA1SQ13698 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CACNA1SQ13698 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CACNA1SQ13698 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CACNA1SQ13698 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CACNA1SQ13698 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CACNA1SQ13698 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CACNA1SQ13698 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CACNA1SQ13698 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CACNA1SQ13698 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CACNA1SQ13698 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CACNA1SQ13698 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CACNA1SQ13698 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CACNA1SQ13698 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CACNA1SQ13698 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CACNA1SQ13698 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CACNA1SQ13698 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CACNA1SQ13698 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CACNA1SQ13698 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CACNA1SQ13698 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CACNA1SQ13698 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CACNA1SQ13698 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CACNA1SQ13698 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CACNA1SQ13698 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CACNA1SQ13698 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CACNA1SQ13698 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CACNA1SQ13698 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CACNA1SQ13698 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CACNA1SQ13698 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CACNA1SQ13698 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CACNA1SQ13698 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CACNA1SQ13698 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CACNA1SQ13698 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CACNA1SQ13698 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CACNA1SQ13698 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CACNA1SQ13698 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CACNA1SQ13698 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CACNA1SQ13698 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CACNA1SQ13698 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CACNA1SQ13698 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CACNA1SQ13698 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
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