Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

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Length 1,082 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
AP3B2Q13367 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
AP3B2Q13367 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
AP3B2Q13367 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
AP3B2Q13367 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
AP3B2Q13367 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
AP3B2Q13367 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
AP3B2Q13367 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
AP3B2Q13367 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
AP3B2Q13367 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
AP3B2Q13367 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
AP3B2Q13367 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
AP3B2Q13367 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
AP3B2Q13367 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
AP3B2Q13367 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
AP3B2Q13367 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
AP3B2Q13367 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
AP3B2Q13367 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
AP3B2Q13367 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
AP3B2Q13367 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
AP3B2Q13367 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
AP3B2Q13367 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
AP3B2Q13367 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
AP3B2Q13367 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
AP3B2Q13367 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
AP3B2Q13367 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
AP3B2Q13367 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
AP3B2Q13367 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
AP3B2Q13367 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
AP3B2Q13367 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
AP3B2Q13367 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
AP3B2Q13367 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
AP3B2Q13367 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
AP3B2Q13367 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
AP3B2Q13367 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
AP3B2Q13367 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
AP3B2Q13367 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
AP3B2Q13367 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
AP3B2Q13367 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
AP3B2Q13367 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
AP3B2Q13367 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
AP3B2Q13367 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
AP3B2Q13367 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
AP3B2Q13367 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
AP3B2Q13367 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
AP3B2Q13367 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
AP3B2Q13367 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
AP3B2Q13367 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
AP3B2Q13367 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
AP3B2Q13367 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
AP3B2Q13367 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
AP3B2Q13367 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
AP3B2Q13367 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
AP3B2Q13367 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
AP3B2Q13367 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
AP3B2Q13367 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
AP3B2Q13367 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
AP3B2Q13367 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
AP3B2Q13367 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
AP3B2Q13367 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
AP3B2Q13367 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
AP3B2Q13367 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
AP3B2Q13367 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
AP3B2Q13367 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
AP3B2Q13367 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
AP3B2Q13367 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
AP3B2Q13367 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
AP3B2Q13367 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
AP3B2Q13367 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
AP3B2Q13367 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
AP3B2Q13367 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
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AP3B2Q13367 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
AP3B2Q13367 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
AP3B2Q13367 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
AP3B2Q13367 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
AP3B2Q13367 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
AP3B2Q13367 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
AP3B2Q13367 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
AP3B2Q13367 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
AP3B2Q13367 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
AP3B2Q13367 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
AP3B2Q13367 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
AP3B2Q13367 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
AP3B2Q13367 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
AP3B2Q13367 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
AP3B2Q13367 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
AP3B2Q13367 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
AP3B2Q13367 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
AP3B2Q13367 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
AP3B2Q13367 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
AP3B2Q13367 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
AP3B2Q13367 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
AP3B2Q13367 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
AP3B2Q13367 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
AP3B2Q13367 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
AP3B2Q13367 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
AP3B2Q13367 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
AP3B2Q13367 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
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