Protein–RNA interactions for Protein: Q13214

SEMA3B, Semaphorin-3B, humanhuman

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Length 749 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3BQ13214 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SEMA3BQ13214 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SEMA3BQ13214 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SEMA3BQ13214 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SEMA3BQ13214 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SEMA3BQ13214 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SEMA3BQ13214 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SEMA3BQ13214 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
SEMA3BQ13214 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
SEMA3BQ13214 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SEMA3BQ13214 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SEMA3BQ13214 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SEMA3BQ13214 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SEMA3BQ13214 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SEMA3BQ13214 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SEMA3BQ13214 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SEMA3BQ13214 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SEMA3BQ13214 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SEMA3BQ13214 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SEMA3BQ13214 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SEMA3BQ13214 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SEMA3BQ13214 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SEMA3BQ13214 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SEMA3BQ13214 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SEMA3BQ13214 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SEMA3BQ13214 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SEMA3BQ13214 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SEMA3BQ13214 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
SEMA3BQ13214 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SEMA3BQ13214 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SEMA3BQ13214 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SEMA3BQ13214 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SEMA3BQ13214 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SEMA3BQ13214 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SEMA3BQ13214 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SEMA3BQ13214 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SEMA3BQ13214 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SEMA3BQ13214 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SEMA3BQ13214 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SEMA3BQ13214 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SEMA3BQ13214 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SEMA3BQ13214 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SEMA3BQ13214 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SEMA3BQ13214 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SEMA3BQ13214 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SEMA3BQ13214 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SEMA3BQ13214 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SEMA3BQ13214 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SEMA3BQ13214 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SEMA3BQ13214 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SEMA3BQ13214 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SEMA3BQ13214 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SEMA3BQ13214 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SEMA3BQ13214 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SEMA3BQ13214 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SEMA3BQ13214 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SEMA3BQ13214 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SEMA3BQ13214 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SEMA3BQ13214 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SEMA3BQ13214 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SEMA3BQ13214 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SEMA3BQ13214 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SEMA3BQ13214 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SEMA3BQ13214 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SEMA3BQ13214 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SEMA3BQ13214 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SEMA3BQ13214 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SEMA3BQ13214 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SEMA3BQ13214 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SEMA3BQ13214 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SEMA3BQ13214 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SEMA3BQ13214 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SEMA3BQ13214 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
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SEMA3BQ13214 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SEMA3BQ13214 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SEMA3BQ13214 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SEMA3BQ13214 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SEMA3BQ13214 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SEMA3BQ13214 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SEMA3BQ13214 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SEMA3BQ13214 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SEMA3BQ13214 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SEMA3BQ13214 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SEMA3BQ13214 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SEMA3BQ13214 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SEMA3BQ13214 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SEMA3BQ13214 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SEMA3BQ13214 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SEMA3BQ13214 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SEMA3BQ13214 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SEMA3BQ13214 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SEMA3BQ13214 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SEMA3BQ13214 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SEMA3BQ13214 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SEMA3BQ13214 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SEMA3BQ13214 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SEMA3BQ13214 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
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