Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CBX3Q13185 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CBX3Q13185 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CBX3Q13185 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CBX3Q13185 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CBX3Q13185 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CBX3Q13185 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CBX3Q13185 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CBX3Q13185 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CBX3Q13185 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CBX3Q13185 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CBX3Q13185 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CBX3Q13185 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CBX3Q13185 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CBX3Q13185 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CBX3Q13185 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CBX3Q13185 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CBX3Q13185 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CBX3Q13185 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CBX3Q13185 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CBX3Q13185 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CBX3Q13185 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CBX3Q13185 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CBX3Q13185 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CBX3Q13185 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CBX3Q13185 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CBX3Q13185 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CBX3Q13185 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CBX3Q13185 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CBX3Q13185 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CBX3Q13185 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CBX3Q13185 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CBX3Q13185 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CBX3Q13185 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CBX3Q13185 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CBX3Q13185 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CBX3Q13185 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CBX3Q13185 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CBX3Q13185 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CBX3Q13185 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CBX3Q13185 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CBX3Q13185 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CBX3Q13185 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CBX3Q13185 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CBX3Q13185 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CBX3Q13185 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CBX3Q13185 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CBX3Q13185 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CBX3Q13185 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CBX3Q13185 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CBX3Q13185 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CBX3Q13185 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CBX3Q13185 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CBX3Q13185 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CBX3Q13185 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CBX3Q13185 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CBX3Q13185 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CBX3Q13185 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CBX3Q13185 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CBX3Q13185 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CBX3Q13185 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CBX3Q13185 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CBX3Q13185 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CBX3Q13185 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CBX3Q13185 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CBX3Q13185 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CBX3Q13185 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CBX3Q13185 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CBX3Q13185 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CBX3Q13185 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CBX3Q13185 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CBX3Q13185 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CBX3Q13185 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CBX3Q13185 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CBX3Q13185 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CBX3Q13185 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CBX3Q13185 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CBX3Q13185 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CBX3Q13185 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CBX3Q13185 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CBX3Q13185 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CBX3Q13185 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CBX3Q13185 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CBX3Q13185 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CBX3Q13185 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CBX3Q13185 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CBX3Q13185 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CBX3Q13185 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CBX3Q13185 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CBX3Q13185 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CBX3Q13185 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CBX3Q13185 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CBX3Q13185 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CBX3Q13185 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CBX3Q13185 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CBX3Q13185 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CBX3Q13185 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CBX3Q13185 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CBX3Q13185 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CBX3Q13185 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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