Protein–RNA interactions for Protein: Q13156

RPA4, Replication protein A 30 kDa subunit, humanhuman

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA4Q13156 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RPA4Q13156 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RPA4Q13156 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RPA4Q13156 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RPA4Q13156 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RPA4Q13156 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RPA4Q13156 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RPA4Q13156 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RPA4Q13156 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RPA4Q13156 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RPA4Q13156 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RPA4Q13156 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RPA4Q13156 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RPA4Q13156 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RPA4Q13156 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RPA4Q13156 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RPA4Q13156 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RPA4Q13156 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RPA4Q13156 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RPA4Q13156 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RPA4Q13156 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RPA4Q13156 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RPA4Q13156 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RPA4Q13156 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RPA4Q13156 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RPA4Q13156 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RPA4Q13156 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RPA4Q13156 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RPA4Q13156 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RPA4Q13156 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RPA4Q13156 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RPA4Q13156 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RPA4Q13156 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RPA4Q13156 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RPA4Q13156 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RPA4Q13156 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RPA4Q13156 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RPA4Q13156 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RPA4Q13156 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RPA4Q13156 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RPA4Q13156 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RPA4Q13156 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RPA4Q13156 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RPA4Q13156 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RPA4Q13156 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RPA4Q13156 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RPA4Q13156 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RPA4Q13156 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RPA4Q13156 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RPA4Q13156 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RPA4Q13156 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RPA4Q13156 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RPA4Q13156 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RPA4Q13156 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RPA4Q13156 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RPA4Q13156 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RPA4Q13156 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RPA4Q13156 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RPA4Q13156 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RPA4Q13156 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
RPA4Q13156 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RPA4Q13156 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RPA4Q13156 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RPA4Q13156 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RPA4Q13156 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RPA4Q13156 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RPA4Q13156 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RPA4Q13156 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RPA4Q13156 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RPA4Q13156 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RPA4Q13156 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RPA4Q13156 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RPA4Q13156 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RPA4Q13156 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RPA4Q13156 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RPA4Q13156 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RPA4Q13156 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RPA4Q13156 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RPA4Q13156 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RPA4Q13156 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
RPA4Q13156 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RPA4Q13156 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RPA4Q13156 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RPA4Q13156 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RPA4Q13156 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RPA4Q13156 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RPA4Q13156 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RPA4Q13156 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RPA4Q13156 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RPA4Q13156 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
RPA4Q13156 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
RPA4Q13156 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RPA4Q13156 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RPA4Q13156 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RPA4Q13156 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
RPA4Q13156 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RPA4Q13156 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RPA4Q13156 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RPA4Q13156 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RPA4Q13156 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
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