Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
MKRN3Q13064 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
MKRN3Q13064 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC20.73■□□□□ 0.91
MKRN3Q13064 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
MKRN3Q13064 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
MKRN3Q13064 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
MKRN3Q13064 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
MKRN3Q13064 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
MKRN3Q13064 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
MKRN3Q13064 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
MKRN3Q13064 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
MKRN3Q13064 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
MKRN3Q13064 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
MKRN3Q13064 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
MKRN3Q13064 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
MKRN3Q13064 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
MKRN3Q13064 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
MKRN3Q13064 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
MKRN3Q13064 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
MKRN3Q13064 LST1-204ENST00000376086 554 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
MKRN3Q13064 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
MKRN3Q13064 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
MKRN3Q13064 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC20.72■□□□□ 0.91
MKRN3Q13064 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
MKRN3Q13064 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
MKRN3Q13064 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
MKRN3Q13064 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
MKRN3Q13064 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
MKRN3Q13064 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
MKRN3Q13064 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
MKRN3Q13064 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
MKRN3Q13064 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
MKRN3Q13064 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
MKRN3Q13064 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
MKRN3Q13064 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
MKRN3Q13064 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
MKRN3Q13064 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
MKRN3Q13064 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
MKRN3Q13064 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
MKRN3Q13064 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
MKRN3Q13064 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
MKRN3Q13064 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
MKRN3Q13064 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
MKRN3Q13064 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
MKRN3Q13064 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
MKRN3Q13064 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
MKRN3Q13064 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
MKRN3Q13064 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
MKRN3Q13064 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
MKRN3Q13064 LINC01551-203ENST00000550266 455 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
MKRN3Q13064 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
MKRN3Q13064 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
MKRN3Q13064 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
MKRN3Q13064 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
MKRN3Q13064 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
MKRN3Q13064 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
MKRN3Q13064 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
MKRN3Q13064 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
MKRN3Q13064 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
MKRN3Q13064 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
MKRN3Q13064 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
MKRN3Q13064 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
MKRN3Q13064 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
MKRN3Q13064 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
MKRN3Q13064 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
MKRN3Q13064 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
MKRN3Q13064 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
MKRN3Q13064 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
MKRN3Q13064 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
MKRN3Q13064 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
MKRN3Q13064 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
MKRN3Q13064 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
MKRN3Q13064 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
MKRN3Q13064 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
MKRN3Q13064 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
MKRN3Q13064 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
MKRN3Q13064 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
MKRN3Q13064 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
MKRN3Q13064 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
MKRN3Q13064 RGS1-203ENST00000469578 1034 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
MKRN3Q13064 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
MKRN3Q13064 AC017007.3-201ENST00000479865 435 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
MKRN3Q13064 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
MKRN3Q13064 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC20.7■□□□□ 0.9
MKRN3Q13064 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
MKRN3Q13064 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
MKRN3Q13064 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
MKRN3Q13064 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
MKRN3Q13064 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
MKRN3Q13064 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
MKRN3Q13064 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
MKRN3Q13064 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
MKRN3Q13064 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
MKRN3Q13064 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
MKRN3Q13064 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
MKRN3Q13064 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
MKRN3Q13064 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
MKRN3Q13064 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
MKRN3Q13064 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
MKRN3Q13064 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
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