Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

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Length 444 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FOXF2Q12947 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
FOXF2Q12947 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FOXF2Q12947 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FOXF2Q12947 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FOXF2Q12947 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FOXF2Q12947 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FOXF2Q12947 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FOXF2Q12947 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FOXF2Q12947 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FOXF2Q12947 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FOXF2Q12947 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FOXF2Q12947 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FOXF2Q12947 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FOXF2Q12947 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FOXF2Q12947 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FOXF2Q12947 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FOXF2Q12947 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FOXF2Q12947 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FOXF2Q12947 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FOXF2Q12947 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FOXF2Q12947 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FOXF2Q12947 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FOXF2Q12947 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
FOXF2Q12947 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FOXF2Q12947 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FOXF2Q12947 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
FOXF2Q12947 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FOXF2Q12947 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FOXF2Q12947 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FOXF2Q12947 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FOXF2Q12947 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FOXF2Q12947 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FOXF2Q12947 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FOXF2Q12947 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FOXF2Q12947 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FOXF2Q12947 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FOXF2Q12947 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FOXF2Q12947 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FOXF2Q12947 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FOXF2Q12947 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
FOXF2Q12947 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FOXF2Q12947 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FOXF2Q12947 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
FOXF2Q12947 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
FOXF2Q12947 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FOXF2Q12947 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FOXF2Q12947 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FOXF2Q12947 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FOXF2Q12947 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
FOXF2Q12947 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FOXF2Q12947 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
FOXF2Q12947 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
FOXF2Q12947 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
FOXF2Q12947 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
FOXF2Q12947 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
FOXF2Q12947 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
FOXF2Q12947 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FOXF2Q12947 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
FOXF2Q12947 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
FOXF2Q12947 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
FOXF2Q12947 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
FOXF2Q12947 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
FOXF2Q12947 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
FOXF2Q12947 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FOXF2Q12947 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
FOXF2Q12947 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
FOXF2Q12947 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FOXF2Q12947 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FOXF2Q12947 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
FOXF2Q12947 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FOXF2Q12947 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FOXF2Q12947 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FOXF2Q12947 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
FOXF2Q12947 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FOXF2Q12947 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
FOXF2Q12947 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
FOXF2Q12947 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FOXF2Q12947 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FOXF2Q12947 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
FOXF2Q12947 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FOXF2Q12947 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FOXF2Q12947 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
FOXF2Q12947 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
FOXF2Q12947 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
FOXF2Q12947 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FOXF2Q12947 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
FOXF2Q12947 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FOXF2Q12947 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FOXF2Q12947 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
FOXF2Q12947 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
FOXF2Q12947 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FOXF2Q12947 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FOXF2Q12947 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
FOXF2Q12947 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FOXF2Q12947 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
FOXF2Q12947 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
FOXF2Q12947 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
FOXF2Q12947 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
FOXF2Q12947 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
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