Protein–RNA interactions for Protein: Q12946

FOXF1, Forkhead box protein F1, humanhuman

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Length 379 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF1Q12946 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FOXF1Q12946 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FOXF1Q12946 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FOXF1Q12946 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FOXF1Q12946 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FOXF1Q12946 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FOXF1Q12946 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FOXF1Q12946 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FOXF1Q12946 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FOXF1Q12946 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FOXF1Q12946 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FOXF1Q12946 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FOXF1Q12946 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
FOXF1Q12946 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FOXF1Q12946 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FOXF1Q12946 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FOXF1Q12946 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FOXF1Q12946 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
FOXF1Q12946 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FOXF1Q12946 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FOXF1Q12946 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FOXF1Q12946 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FOXF1Q12946 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FOXF1Q12946 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FOXF1Q12946 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FOXF1Q12946 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FOXF1Q12946 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FOXF1Q12946 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
FOXF1Q12946 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FOXF1Q12946 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FOXF1Q12946 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FOXF1Q12946 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FOXF1Q12946 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FOXF1Q12946 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FOXF1Q12946 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FOXF1Q12946 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FOXF1Q12946 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
FOXF1Q12946 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FOXF1Q12946 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FOXF1Q12946 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FOXF1Q12946 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
FOXF1Q12946 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
FOXF1Q12946 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FOXF1Q12946 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FOXF1Q12946 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
FOXF1Q12946 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FOXF1Q12946 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FOXF1Q12946 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FOXF1Q12946 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FOXF1Q12946 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FOXF1Q12946 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FOXF1Q12946 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FOXF1Q12946 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FOXF1Q12946 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FOXF1Q12946 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FOXF1Q12946 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FOXF1Q12946 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FOXF1Q12946 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FOXF1Q12946 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FOXF1Q12946 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FOXF1Q12946 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FOXF1Q12946 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FOXF1Q12946 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FOXF1Q12946 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FOXF1Q12946 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FOXF1Q12946 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FOXF1Q12946 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FOXF1Q12946 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FOXF1Q12946 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FOXF1Q12946 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FOXF1Q12946 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FOXF1Q12946 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FOXF1Q12946 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FOXF1Q12946 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FOXF1Q12946 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FOXF1Q12946 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FOXF1Q12946 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
FOXF1Q12946 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FOXF1Q12946 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FOXF1Q12946 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FOXF1Q12946 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FOXF1Q12946 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FOXF1Q12946 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FOXF1Q12946 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
FOXF1Q12946 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FOXF1Q12946 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FOXF1Q12946 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FOXF1Q12946 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FOXF1Q12946 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FOXF1Q12946 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FOXF1Q12946 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FOXF1Q12946 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FOXF1Q12946 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FOXF1Q12946 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FOXF1Q12946 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FOXF1Q12946 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FOXF1Q12946 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FOXF1Q12946 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FOXF1Q12946 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FOXF1Q12946 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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