Protein–RNA interactions for Protein: Q12857

NFIA, Nuclear factor 1 A-type, humanhuman

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Length 509 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIAQ12857 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NFIAQ12857 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NFIAQ12857 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NFIAQ12857 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NFIAQ12857 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NFIAQ12857 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NFIAQ12857 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NFIAQ12857 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NFIAQ12857 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NFIAQ12857 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NFIAQ12857 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NFIAQ12857 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NFIAQ12857 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NFIAQ12857 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NFIAQ12857 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NFIAQ12857 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NFIAQ12857 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NFIAQ12857 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NFIAQ12857 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NFIAQ12857 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NFIAQ12857 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NFIAQ12857 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NFIAQ12857 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NFIAQ12857 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NFIAQ12857 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NFIAQ12857 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NFIAQ12857 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NFIAQ12857 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NFIAQ12857 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
NFIAQ12857 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NFIAQ12857 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NFIAQ12857 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NFIAQ12857 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NFIAQ12857 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NFIAQ12857 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NFIAQ12857 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NFIAQ12857 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NFIAQ12857 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NFIAQ12857 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NFIAQ12857 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NFIAQ12857 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NFIAQ12857 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NFIAQ12857 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NFIAQ12857 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NFIAQ12857 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NFIAQ12857 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NFIAQ12857 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NFIAQ12857 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NFIAQ12857 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NFIAQ12857 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NFIAQ12857 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NFIAQ12857 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NFIAQ12857 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NFIAQ12857 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NFIAQ12857 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NFIAQ12857 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NFIAQ12857 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
NFIAQ12857 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NFIAQ12857 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NFIAQ12857 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NFIAQ12857 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NFIAQ12857 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NFIAQ12857 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NFIAQ12857 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
NFIAQ12857 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NFIAQ12857 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NFIAQ12857 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NFIAQ12857 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NFIAQ12857 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
NFIAQ12857 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NFIAQ12857 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NFIAQ12857 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NFIAQ12857 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NFIAQ12857 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NFIAQ12857 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NFIAQ12857 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NFIAQ12857 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NFIAQ12857 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NFIAQ12857 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NFIAQ12857 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NFIAQ12857 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NFIAQ12857 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NFIAQ12857 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
NFIAQ12857 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NFIAQ12857 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NFIAQ12857 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NFIAQ12857 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
NFIAQ12857 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NFIAQ12857 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NFIAQ12857 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NFIAQ12857 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NFIAQ12857 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
NFIAQ12857 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NFIAQ12857 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NFIAQ12857 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NFIAQ12857 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NFIAQ12857 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NFIAQ12857 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NFIAQ12857 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NFIAQ12857 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
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