Protein–RNA interactions for Protein: Q12791

KCNMA1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,236 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMA1Q12791 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KCNMA1Q12791 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
KCNMA1Q12791 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
KCNMA1Q12791 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
KCNMA1Q12791 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
KCNMA1Q12791 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KCNMA1Q12791 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
KCNMA1Q12791 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
KCNMA1Q12791 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KCNMA1Q12791 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KCNMA1Q12791 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KCNMA1Q12791 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
KCNMA1Q12791 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
KCNMA1Q12791 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
KCNMA1Q12791 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
KCNMA1Q12791 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KCNMA1Q12791 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KCNMA1Q12791 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KCNMA1Q12791 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KCNMA1Q12791 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
KCNMA1Q12791 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KCNMA1Q12791 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KCNMA1Q12791 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KCNMA1Q12791 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KCNMA1Q12791 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
KCNMA1Q12791 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
KCNMA1Q12791 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
KCNMA1Q12791 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
KCNMA1Q12791 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
KCNMA1Q12791 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
KCNMA1Q12791 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
KCNMA1Q12791 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
KCNMA1Q12791 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
KCNMA1Q12791 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
KCNMA1Q12791 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
KCNMA1Q12791 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
KCNMA1Q12791 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
KCNMA1Q12791 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
KCNMA1Q12791 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
KCNMA1Q12791 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
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KCNMA1Q12791 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
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KCNMA1Q12791 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
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KCNMA1Q12791 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
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KCNMA1Q12791 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
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KCNMA1Q12791 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
KCNMA1Q12791 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
KCNMA1Q12791 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
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KCNMA1Q12791 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
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KCNMA1Q12791 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
KCNMA1Q12791 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
KCNMA1Q12791 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
KCNMA1Q12791 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
KCNMA1Q12791 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
KCNMA1Q12791 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
KCNMA1Q12791 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
KCNMA1Q12791 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
KCNMA1Q12791 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
KCNMA1Q12791 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
KCNMA1Q12791 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
KCNMA1Q12791 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
KCNMA1Q12791 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
KCNMA1Q12791 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
KCNMA1Q12791 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
KCNMA1Q12791 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
KCNMA1Q12791 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
KCNMA1Q12791 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
KCNMA1Q12791 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
KCNMA1Q12791 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
KCNMA1Q12791 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
KCNMA1Q12791 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
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