Protein–RNA interactions for Protein: Q11206

ST3GAL4, CMP-N-acetylneuraminate-beta-galactosamide-alpha-2,3-sialyltransferase 4, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ST3GAL4Q11206 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ST3GAL4Q11206 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ST3GAL4Q11206 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ST3GAL4Q11206 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ST3GAL4Q11206 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ST3GAL4Q11206 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ST3GAL4Q11206 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ST3GAL4Q11206 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ST3GAL4Q11206 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ST3GAL4Q11206 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ST3GAL4Q11206 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ST3GAL4Q11206 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ST3GAL4Q11206 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ST3GAL4Q11206 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ST3GAL4Q11206 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ST3GAL4Q11206 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ST3GAL4Q11206 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ST3GAL4Q11206 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ST3GAL4Q11206 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ST3GAL4Q11206 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ST3GAL4Q11206 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ST3GAL4Q11206 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ST3GAL4Q11206 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ST3GAL4Q11206 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ST3GAL4Q11206 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ST3GAL4Q11206 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ST3GAL4Q11206 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ST3GAL4Q11206 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ST3GAL4Q11206 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ST3GAL4Q11206 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ST3GAL4Q11206 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ST3GAL4Q11206 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ST3GAL4Q11206 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ST3GAL4Q11206 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ST3GAL4Q11206 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ST3GAL4Q11206 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ST3GAL4Q11206 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ST3GAL4Q11206 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ST3GAL4Q11206 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ST3GAL4Q11206 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ST3GAL4Q11206 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ST3GAL4Q11206 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ST3GAL4Q11206 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ST3GAL4Q11206 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ST3GAL4Q11206 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ST3GAL4Q11206 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ST3GAL4Q11206 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ST3GAL4Q11206 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ST3GAL4Q11206 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
ST3GAL4Q11206 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
ST3GAL4Q11206 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
ST3GAL4Q11206 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ST3GAL4Q11206 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ST3GAL4Q11206 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ST3GAL4Q11206 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ST3GAL4Q11206 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ST3GAL4Q11206 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ST3GAL4Q11206 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ST3GAL4Q11206 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ST3GAL4Q11206 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ST3GAL4Q11206 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ST3GAL4Q11206 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ST3GAL4Q11206 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ST3GAL4Q11206 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ST3GAL4Q11206 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ST3GAL4Q11206 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ST3GAL4Q11206 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ST3GAL4Q11206 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ST3GAL4Q11206 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ST3GAL4Q11206 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ST3GAL4Q11206 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ST3GAL4Q11206 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ST3GAL4Q11206 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ST3GAL4Q11206 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ST3GAL4Q11206 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ST3GAL4Q11206 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ST3GAL4Q11206 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ST3GAL4Q11206 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ST3GAL4Q11206 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ST3GAL4Q11206 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ST3GAL4Q11206 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ST3GAL4Q11206 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ST3GAL4Q11206 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ST3GAL4Q11206 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ST3GAL4Q11206 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ST3GAL4Q11206 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ST3GAL4Q11206 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ST3GAL4Q11206 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ST3GAL4Q11206 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ST3GAL4Q11206 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ST3GAL4Q11206 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ST3GAL4Q11206 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ST3GAL4Q11206 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ST3GAL4Q11206 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ST3GAL4Q11206 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ST3GAL4Q11206 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ST3GAL4Q11206 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ST3GAL4Q11206 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ST3GAL4Q11206 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ST3GAL4Q11206 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms