Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
IFFO1Q0D2I5 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IFFO1Q0D2I5 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
IFFO1Q0D2I5 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
IFFO1Q0D2I5 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
IFFO1Q0D2I5 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
IFFO1Q0D2I5 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
IFFO1Q0D2I5 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
IFFO1Q0D2I5 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
IFFO1Q0D2I5 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
IFFO1Q0D2I5 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
IFFO1Q0D2I5 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
IFFO1Q0D2I5 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
IFFO1Q0D2I5 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
IFFO1Q0D2I5 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
IFFO1Q0D2I5 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
IFFO1Q0D2I5 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
IFFO1Q0D2I5 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
IFFO1Q0D2I5 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
IFFO1Q0D2I5 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
IFFO1Q0D2I5 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
IFFO1Q0D2I5 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
IFFO1Q0D2I5 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
IFFO1Q0D2I5 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
IFFO1Q0D2I5 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
IFFO1Q0D2I5 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
IFFO1Q0D2I5 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
IFFO1Q0D2I5 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
IFFO1Q0D2I5 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
IFFO1Q0D2I5 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
IFFO1Q0D2I5 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
IFFO1Q0D2I5 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
IFFO1Q0D2I5 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
IFFO1Q0D2I5 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
IFFO1Q0D2I5 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
IFFO1Q0D2I5 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
IFFO1Q0D2I5 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
IFFO1Q0D2I5 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
IFFO1Q0D2I5 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
IFFO1Q0D2I5 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
IFFO1Q0D2I5 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
IFFO1Q0D2I5 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
IFFO1Q0D2I5 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
IFFO1Q0D2I5 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
IFFO1Q0D2I5 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
IFFO1Q0D2I5 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
IFFO1Q0D2I5 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
IFFO1Q0D2I5 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
IFFO1Q0D2I5 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
IFFO1Q0D2I5 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
IFFO1Q0D2I5 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
IFFO1Q0D2I5 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
IFFO1Q0D2I5 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
IFFO1Q0D2I5 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
IFFO1Q0D2I5 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
IFFO1Q0D2I5 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
IFFO1Q0D2I5 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
IFFO1Q0D2I5 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
IFFO1Q0D2I5 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
IFFO1Q0D2I5 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
IFFO1Q0D2I5 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
IFFO1Q0D2I5 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
IFFO1Q0D2I5 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
IFFO1Q0D2I5 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
IFFO1Q0D2I5 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
IFFO1Q0D2I5 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
IFFO1Q0D2I5 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
IFFO1Q0D2I5 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
IFFO1Q0D2I5 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
IFFO1Q0D2I5 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
IFFO1Q0D2I5 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
IFFO1Q0D2I5 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
IFFO1Q0D2I5 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
IFFO1Q0D2I5 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
IFFO1Q0D2I5 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
IFFO1Q0D2I5 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
IFFO1Q0D2I5 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
IFFO1Q0D2I5 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
IFFO1Q0D2I5 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
IFFO1Q0D2I5 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
IFFO1Q0D2I5 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
IFFO1Q0D2I5 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
IFFO1Q0D2I5 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
IFFO1Q0D2I5 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
IFFO1Q0D2I5 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
IFFO1Q0D2I5 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
IFFO1Q0D2I5 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
IFFO1Q0D2I5 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
IFFO1Q0D2I5 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
IFFO1Q0D2I5 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
IFFO1Q0D2I5 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
IFFO1Q0D2I5 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.54
IFFO1Q0D2I5 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
IFFO1Q0D2I5 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
IFFO1Q0D2I5 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
IFFO1Q0D2I5 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
IFFO1Q0D2I5 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
IFFO1Q0D2I5 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
IFFO1Q0D2I5 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
IFFO1Q0D2I5 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms