Protein–RNA interactions for Protein: Q09161

NCBP1, Nuclear cap-binding protein subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCBP1Q09161 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NCBP1Q09161 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NCBP1Q09161 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NCBP1Q09161 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NCBP1Q09161 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NCBP1Q09161 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NCBP1Q09161 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NCBP1Q09161 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NCBP1Q09161 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NCBP1Q09161 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NCBP1Q09161 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NCBP1Q09161 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NCBP1Q09161 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NCBP1Q09161 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NCBP1Q09161 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NCBP1Q09161 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NCBP1Q09161 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NCBP1Q09161 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NCBP1Q09161 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NCBP1Q09161 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NCBP1Q09161 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NCBP1Q09161 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NCBP1Q09161 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NCBP1Q09161 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
NCBP1Q09161 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NCBP1Q09161 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
NCBP1Q09161 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NCBP1Q09161 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NCBP1Q09161 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NCBP1Q09161 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NCBP1Q09161 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NCBP1Q09161 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NCBP1Q09161 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NCBP1Q09161 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NCBP1Q09161 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NCBP1Q09161 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NCBP1Q09161 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NCBP1Q09161 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NCBP1Q09161 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NCBP1Q09161 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NCBP1Q09161 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NCBP1Q09161 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NCBP1Q09161 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NCBP1Q09161 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NCBP1Q09161 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NCBP1Q09161 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NCBP1Q09161 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NCBP1Q09161 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NCBP1Q09161 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NCBP1Q09161 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NCBP1Q09161 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NCBP1Q09161 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NCBP1Q09161 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NCBP1Q09161 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NCBP1Q09161 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
NCBP1Q09161 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NCBP1Q09161 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NCBP1Q09161 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NCBP1Q09161 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NCBP1Q09161 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NCBP1Q09161 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NCBP1Q09161 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NCBP1Q09161 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NCBP1Q09161 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NCBP1Q09161 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NCBP1Q09161 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NCBP1Q09161 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NCBP1Q09161 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NCBP1Q09161 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NCBP1Q09161 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NCBP1Q09161 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NCBP1Q09161 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NCBP1Q09161 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NCBP1Q09161 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
NCBP1Q09161 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NCBP1Q09161 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NCBP1Q09161 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NCBP1Q09161 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NCBP1Q09161 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NCBP1Q09161 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NCBP1Q09161 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NCBP1Q09161 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NCBP1Q09161 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NCBP1Q09161 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NCBP1Q09161 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NCBP1Q09161 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NCBP1Q09161 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NCBP1Q09161 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NCBP1Q09161 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NCBP1Q09161 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NCBP1Q09161 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NCBP1Q09161 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NCBP1Q09161 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NCBP1Q09161 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NCBP1Q09161 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NCBP1Q09161 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NCBP1Q09161 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NCBP1Q09161 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NCBP1Q09161 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NCBP1Q09161 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms