Protein–RNA interactions for Protein: Q08211

DHX9, ATP-dependent RNA helicase A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DHX9Q08211 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DHX9Q08211 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DHX9Q08211 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DHX9Q08211 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DHX9Q08211 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DHX9Q08211 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DHX9Q08211 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DHX9Q08211 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DHX9Q08211 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DHX9Q08211 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DHX9Q08211 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DHX9Q08211 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DHX9Q08211 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DHX9Q08211 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DHX9Q08211 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DHX9Q08211 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DHX9Q08211 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DHX9Q08211 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
DHX9Q08211 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DHX9Q08211 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DHX9Q08211 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
DHX9Q08211 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DHX9Q08211 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DHX9Q08211 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DHX9Q08211 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DHX9Q08211 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DHX9Q08211 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DHX9Q08211 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DHX9Q08211 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
DHX9Q08211 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DHX9Q08211 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
DHX9Q08211 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DHX9Q08211 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DHX9Q08211 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
DHX9Q08211 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DHX9Q08211 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DHX9Q08211 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DHX9Q08211 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DHX9Q08211 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DHX9Q08211 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
DHX9Q08211 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DHX9Q08211 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DHX9Q08211 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DHX9Q08211 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DHX9Q08211 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DHX9Q08211 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DHX9Q08211 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DHX9Q08211 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DHX9Q08211 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DHX9Q08211 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DHX9Q08211 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DHX9Q08211 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DHX9Q08211 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DHX9Q08211 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DHX9Q08211 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DHX9Q08211 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DHX9Q08211 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DHX9Q08211 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DHX9Q08211 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
DHX9Q08211 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
DHX9Q08211 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DHX9Q08211 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DHX9Q08211 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DHX9Q08211 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
DHX9Q08211 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DHX9Q08211 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DHX9Q08211 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DHX9Q08211 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DHX9Q08211 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DHX9Q08211 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DHX9Q08211 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DHX9Q08211 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DHX9Q08211 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DHX9Q08211 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DHX9Q08211 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
DHX9Q08211 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DHX9Q08211 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DHX9Q08211 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DHX9Q08211 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DHX9Q08211 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DHX9Q08211 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
DHX9Q08211 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DHX9Q08211 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DHX9Q08211 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DHX9Q08211 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DHX9Q08211 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DHX9Q08211 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DHX9Q08211 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DHX9Q08211 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DHX9Q08211 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DHX9Q08211 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DHX9Q08211 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DHX9Q08211 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DHX9Q08211 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DHX9Q08211 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DHX9Q08211 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DHX9Q08211 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DHX9Q08211 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DHX9Q08211 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DHX9Q08211 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms