Protein–RNA interactions for Protein: Q06432

CACNG1, Voltage-dependent calcium channel gamma-1 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG1Q06432 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CACNG1Q06432 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CACNG1Q06432 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CACNG1Q06432 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNG1Q06432 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNG1Q06432 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNG1Q06432 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNG1Q06432 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNG1Q06432 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNG1Q06432 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNG1Q06432 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNG1Q06432 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNG1Q06432 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNG1Q06432 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNG1Q06432 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNG1Q06432 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNG1Q06432 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNG1Q06432 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNG1Q06432 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNG1Q06432 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNG1Q06432 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNG1Q06432 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNG1Q06432 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNG1Q06432 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNG1Q06432 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNG1Q06432 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNG1Q06432 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNG1Q06432 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNG1Q06432 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNG1Q06432 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNG1Q06432 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNG1Q06432 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNG1Q06432 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNG1Q06432 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNG1Q06432 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNG1Q06432 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNG1Q06432 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNG1Q06432 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNG1Q06432 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNG1Q06432 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNG1Q06432 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNG1Q06432 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNG1Q06432 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNG1Q06432 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNG1Q06432 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNG1Q06432 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNG1Q06432 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNG1Q06432 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNG1Q06432 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNG1Q06432 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNG1Q06432 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNG1Q06432 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNG1Q06432 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNG1Q06432 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNG1Q06432 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNG1Q06432 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNG1Q06432 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNG1Q06432 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNG1Q06432 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNG1Q06432 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNG1Q06432 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNG1Q06432 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNG1Q06432 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNG1Q06432 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNG1Q06432 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNG1Q06432 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNG1Q06432 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNG1Q06432 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNG1Q06432 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNG1Q06432 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNG1Q06432 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CACNG1Q06432 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CACNG1Q06432 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CACNG1Q06432 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CACNG1Q06432 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CACNG1Q06432 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CACNG1Q06432 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CACNG1Q06432 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CACNG1Q06432 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CACNG1Q06432 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CACNG1Q06432 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CACNG1Q06432 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CACNG1Q06432 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CACNG1Q06432 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CACNG1Q06432 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CACNG1Q06432 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CACNG1Q06432 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CACNG1Q06432 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CACNG1Q06432 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CACNG1Q06432 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CACNG1Q06432 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CACNG1Q06432 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CACNG1Q06432 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CACNG1Q06432 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CACNG1Q06432 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
CACNG1Q06432 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
CACNG1Q06432 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
CACNG1Q06432 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CACNG1Q06432 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CACNG1Q06432 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.8 ms