Protein–RNA interactions for Protein: Q05682

CALD1, Caldesmon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALD1Q05682 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CALD1Q05682 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CALD1Q05682 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CALD1Q05682 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CALD1Q05682 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CALD1Q05682 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CALD1Q05682 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CALD1Q05682 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CALD1Q05682 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CALD1Q05682 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CALD1Q05682 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CALD1Q05682 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CALD1Q05682 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CALD1Q05682 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CALD1Q05682 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CALD1Q05682 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CALD1Q05682 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CALD1Q05682 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CALD1Q05682 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CALD1Q05682 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CALD1Q05682 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CALD1Q05682 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CALD1Q05682 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CALD1Q05682 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CALD1Q05682 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CALD1Q05682 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CALD1Q05682 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CALD1Q05682 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CALD1Q05682 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CALD1Q05682 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CALD1Q05682 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CALD1Q05682 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CALD1Q05682 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CALD1Q05682 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CALD1Q05682 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CALD1Q05682 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CALD1Q05682 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CALD1Q05682 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CALD1Q05682 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CALD1Q05682 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CALD1Q05682 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CALD1Q05682 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CALD1Q05682 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CALD1Q05682 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CALD1Q05682 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CALD1Q05682 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CALD1Q05682 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CALD1Q05682 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CALD1Q05682 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CALD1Q05682 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CALD1Q05682 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CALD1Q05682 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CALD1Q05682 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CALD1Q05682 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CALD1Q05682 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CALD1Q05682 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CALD1Q05682 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CALD1Q05682 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CALD1Q05682 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CALD1Q05682 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CALD1Q05682 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CALD1Q05682 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CALD1Q05682 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CALD1Q05682 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CALD1Q05682 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CALD1Q05682 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CALD1Q05682 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CALD1Q05682 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CALD1Q05682 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CALD1Q05682 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CALD1Q05682 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CALD1Q05682 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CALD1Q05682 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CALD1Q05682 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CALD1Q05682 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CALD1Q05682 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CALD1Q05682 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CALD1Q05682 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CALD1Q05682 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CALD1Q05682 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CALD1Q05682 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CALD1Q05682 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CALD1Q05682 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CALD1Q05682 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CALD1Q05682 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CALD1Q05682 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CALD1Q05682 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CALD1Q05682 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CALD1Q05682 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CALD1Q05682 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CALD1Q05682 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CALD1Q05682 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CALD1Q05682 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CALD1Q05682 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CALD1Q05682 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CALD1Q05682 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CALD1Q05682 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CALD1Q05682 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CALD1Q05682 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CALD1Q05682 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms