Protein–RNA interactions for Protein: Q02742

GCNT1, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNT1Q02742 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GCNT1Q02742 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GCNT1Q02742 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GCNT1Q02742 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GCNT1Q02742 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GCNT1Q02742 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GCNT1Q02742 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GCNT1Q02742 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GCNT1Q02742 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GCNT1Q02742 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GCNT1Q02742 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GCNT1Q02742 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GCNT1Q02742 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GCNT1Q02742 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GCNT1Q02742 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GCNT1Q02742 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GCNT1Q02742 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GCNT1Q02742 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GCNT1Q02742 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GCNT1Q02742 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GCNT1Q02742 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GCNT1Q02742 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GCNT1Q02742 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GCNT1Q02742 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GCNT1Q02742 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GCNT1Q02742 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GCNT1Q02742 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GCNT1Q02742 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
GCNT1Q02742 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GCNT1Q02742 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GCNT1Q02742 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GCNT1Q02742 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GCNT1Q02742 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GCNT1Q02742 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GCNT1Q02742 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GCNT1Q02742 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GCNT1Q02742 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GCNT1Q02742 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GCNT1Q02742 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
GCNT1Q02742 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GCNT1Q02742 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GCNT1Q02742 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GCNT1Q02742 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GCNT1Q02742 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GCNT1Q02742 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GCNT1Q02742 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GCNT1Q02742 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GCNT1Q02742 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GCNT1Q02742 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GCNT1Q02742 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GCNT1Q02742 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GCNT1Q02742 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GCNT1Q02742 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GCNT1Q02742 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GCNT1Q02742 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GCNT1Q02742 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GCNT1Q02742 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
GCNT1Q02742 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
GCNT1Q02742 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
GCNT1Q02742 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GCNT1Q02742 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
GCNT1Q02742 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
GCNT1Q02742 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
GCNT1Q02742 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
GCNT1Q02742 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GCNT1Q02742 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GCNT1Q02742 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GCNT1Q02742 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GCNT1Q02742 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GCNT1Q02742 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GCNT1Q02742 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GCNT1Q02742 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GCNT1Q02742 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GCNT1Q02742 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GCNT1Q02742 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GCNT1Q02742 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GCNT1Q02742 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GCNT1Q02742 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GCNT1Q02742 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GCNT1Q02742 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GCNT1Q02742 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GCNT1Q02742 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GCNT1Q02742 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
GCNT1Q02742 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GCNT1Q02742 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GCNT1Q02742 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GCNT1Q02742 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GCNT1Q02742 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GCNT1Q02742 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GCNT1Q02742 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GCNT1Q02742 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GCNT1Q02742 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GCNT1Q02742 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GCNT1Q02742 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
GCNT1Q02742 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GCNT1Q02742 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GCNT1Q02742 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GCNT1Q02742 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GCNT1Q02742 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GCNT1Q02742 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms