Protein–RNA interactions for Protein: Q02413

DSG1, Desmoglein-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,049 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG1Q02413 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DSG1Q02413 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DSG1Q02413 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DSG1Q02413 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DSG1Q02413 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
DSG1Q02413 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DSG1Q02413 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
DSG1Q02413 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DSG1Q02413 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
DSG1Q02413 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
DSG1Q02413 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DSG1Q02413 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
DSG1Q02413 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
DSG1Q02413 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DSG1Q02413 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DSG1Q02413 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DSG1Q02413 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DSG1Q02413 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
DSG1Q02413 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DSG1Q02413 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
DSG1Q02413 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DSG1Q02413 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
DSG1Q02413 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
DSG1Q02413 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
DSG1Q02413 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
DSG1Q02413 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DSG1Q02413 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
DSG1Q02413 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
DSG1Q02413 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
DSG1Q02413 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DSG1Q02413 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DSG1Q02413 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
DSG1Q02413 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
DSG1Q02413 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DSG1Q02413 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
DSG1Q02413 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
DSG1Q02413 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DSG1Q02413 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DSG1Q02413 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
DSG1Q02413 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
DSG1Q02413 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
DSG1Q02413 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
DSG1Q02413 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
DSG1Q02413 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
DSG1Q02413 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
DSG1Q02413 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
DSG1Q02413 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
DSG1Q02413 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
DSG1Q02413 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
DSG1Q02413 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
DSG1Q02413 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
DSG1Q02413 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
DSG1Q02413 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
DSG1Q02413 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
DSG1Q02413 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
DSG1Q02413 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
DSG1Q02413 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
DSG1Q02413 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
DSG1Q02413 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
DSG1Q02413 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
DSG1Q02413 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
DSG1Q02413 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
DSG1Q02413 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
DSG1Q02413 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
DSG1Q02413 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
DSG1Q02413 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
DSG1Q02413 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
DSG1Q02413 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
DSG1Q02413 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
DSG1Q02413 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
DSG1Q02413 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
DSG1Q02413 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
DSG1Q02413 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
DSG1Q02413 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
DSG1Q02413 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
DSG1Q02413 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
DSG1Q02413 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
DSG1Q02413 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
DSG1Q02413 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
DSG1Q02413 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
DSG1Q02413 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
DSG1Q02413 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
DSG1Q02413 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
DSG1Q02413 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
DSG1Q02413 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
DSG1Q02413 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
DSG1Q02413 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
DSG1Q02413 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
DSG1Q02413 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
DSG1Q02413 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
DSG1Q02413 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
DSG1Q02413 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
DSG1Q02413 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
DSG1Q02413 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
DSG1Q02413 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
DSG1Q02413 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DSG1Q02413 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DSG1Q02413 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
DSG1Q02413 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DSG1Q02413 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms