Protein–RNA interactions for Protein: Q01954

BNC1, Zinc finger protein basonuclin-1, humanhuman

Predictions only

Length 994 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNC1Q01954 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BNC1Q01954 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
BNC1Q01954 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BNC1Q01954 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BNC1Q01954 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BNC1Q01954 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
BNC1Q01954 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
BNC1Q01954 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BNC1Q01954 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BNC1Q01954 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BNC1Q01954 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BNC1Q01954 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BNC1Q01954 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BNC1Q01954 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
BNC1Q01954 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
BNC1Q01954 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
BNC1Q01954 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
BNC1Q01954 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
BNC1Q01954 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
BNC1Q01954 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
BNC1Q01954 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
BNC1Q01954 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
BNC1Q01954 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
BNC1Q01954 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
BNC1Q01954 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
BNC1Q01954 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
BNC1Q01954 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
BNC1Q01954 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
BNC1Q01954 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
BNC1Q01954 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
BNC1Q01954 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
BNC1Q01954 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
BNC1Q01954 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
BNC1Q01954 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
BNC1Q01954 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
BNC1Q01954 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
BNC1Q01954 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
BNC1Q01954 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
BNC1Q01954 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
BNC1Q01954 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
BNC1Q01954 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BNC1Q01954 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BNC1Q01954 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
BNC1Q01954 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BNC1Q01954 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BNC1Q01954 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BNC1Q01954 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BNC1Q01954 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BNC1Q01954 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
BNC1Q01954 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
BNC1Q01954 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BNC1Q01954 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
BNC1Q01954 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BNC1Q01954 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BNC1Q01954 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
BNC1Q01954 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
BNC1Q01954 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BNC1Q01954 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
BNC1Q01954 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
BNC1Q01954 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
BNC1Q01954 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
BNC1Q01954 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
BNC1Q01954 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
BNC1Q01954 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BNC1Q01954 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
BNC1Q01954 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
BNC1Q01954 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BNC1Q01954 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
BNC1Q01954 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BNC1Q01954 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
BNC1Q01954 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
BNC1Q01954 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BNC1Q01954 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
BNC1Q01954 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
BNC1Q01954 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BNC1Q01954 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
BNC1Q01954 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BNC1Q01954 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BNC1Q01954 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BNC1Q01954 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BNC1Q01954 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BNC1Q01954 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
BNC1Q01954 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BNC1Q01954 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
BNC1Q01954 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BNC1Q01954 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BNC1Q01954 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BNC1Q01954 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BNC1Q01954 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BNC1Q01954 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BNC1Q01954 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BNC1Q01954 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BNC1Q01954 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
BNC1Q01954 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BNC1Q01954 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
BNC1Q01954 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BNC1Q01954 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BNC1Q01954 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BNC1Q01954 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BNC1Q01954 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms