Protein–RNA interactions for Protein: Q00987

MDM2, E3 ubiquitin-protein ligase Mdm2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDM2Q00987 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MDM2Q00987 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
MDM2Q00987 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MDM2Q00987 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
MDM2Q00987 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
MDM2Q00987 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MDM2Q00987 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
MDM2Q00987 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MDM2Q00987 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
MDM2Q00987 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
MDM2Q00987 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
MDM2Q00987 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
MDM2Q00987 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
MDM2Q00987 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
MDM2Q00987 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
MDM2Q00987 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
MDM2Q00987 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
MDM2Q00987 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
MDM2Q00987 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
MDM2Q00987 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
MDM2Q00987 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
MDM2Q00987 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
MDM2Q00987 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
MDM2Q00987 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
MDM2Q00987 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
MDM2Q00987 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
MDM2Q00987 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
MDM2Q00987 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
MDM2Q00987 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
MDM2Q00987 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
MDM2Q00987 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
MDM2Q00987 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
MDM2Q00987 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
MDM2Q00987 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
MDM2Q00987 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
MDM2Q00987 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MDM2Q00987 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MDM2Q00987 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MDM2Q00987 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
MDM2Q00987 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MDM2Q00987 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
MDM2Q00987 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
MDM2Q00987 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
MDM2Q00987 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MDM2Q00987 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
MDM2Q00987 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
MDM2Q00987 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
MDM2Q00987 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
MDM2Q00987 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC20.55■□□□□ 0.88
MDM2Q00987 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
MDM2Q00987 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
MDM2Q00987 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
MDM2Q00987 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MDM2Q00987 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
MDM2Q00987 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MDM2Q00987 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MDM2Q00987 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MDM2Q00987 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
MDM2Q00987 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
MDM2Q00987 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MDM2Q00987 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MDM2Q00987 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
MDM2Q00987 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MDM2Q00987 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
MDM2Q00987 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MDM2Q00987 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MDM2Q00987 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MDM2Q00987 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MDM2Q00987 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
MDM2Q00987 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
MDM2Q00987 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
MDM2Q00987 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MDM2Q00987 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MDM2Q00987 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
MDM2Q00987 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC20.54■□□□□ 0.88
MDM2Q00987 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
MDM2Q00987 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MDM2Q00987 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MDM2Q00987 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC20.54■□□□□ 0.88
MDM2Q00987 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
MDM2Q00987 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MDM2Q00987 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MDM2Q00987 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MDM2Q00987 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
MDM2Q00987 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MDM2Q00987 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MDM2Q00987 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
MDM2Q00987 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
MDM2Q00987 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MDM2Q00987 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MDM2Q00987 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MDM2Q00987 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MDM2Q00987 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MDM2Q00987 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MDM2Q00987 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MDM2Q00987 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
MDM2Q00987 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MDM2Q00987 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MDM2Q00987 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
MDM2Q00987 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms